离子空气净化器和臭氧空气净化器备受消费者团体、消费者评论杂志乃至美国环保局（EPA）的批评。争议的两个焦点问题是：首先，这两种空气净化器不能有效地去除空气中的污染物；其次，臭氧发生器可能对人体有害。
在2002和2003年，Consumer Reports测试了几种不同的空气净化器，包括Sharper Image公司的Ionic Breeze。独立研究机构对测试结果进行了审查和验证。Consumer Reports发现，诸如Ionic Breeze之类的离子空气净化器“所减少的空气颗粒物几乎测量不到”（参考）。Sharper Image公司为此还起诉了Consumer Reports。受到Sharper Image指控后，该杂志又进行了测试，结果仍然发现Ionic Breeze不起作用。Sharper Image对Consumer Reports的起诉被驳回，并且还为Consumer Reports支付了五十多万美元的诉讼费。
EPA也发布了一些信息，提醒公众提防产生臭氧的空气净化器。由于制造商并未声称这些空气净化器的医疗作用，因此，这些产品无须得到美国食品药品管理局（FDA）的批准。事实上，除HEPA标准外，政府对家用空气净化器再没有其他监管，因此，任何声称此类设备“得到政府批准”或“得到政府认证”的制造商都是在误导消费者。不过，出于对在居民家中产生臭氧的担心，EPA已着手进行立项研究。
所有离子空气净化器都会产生一些臭氧，但臭氧发生器是专门为释放臭氧而设计的，其产生的臭氧比离子空气净化器要多得多。EPA称：“少量（臭氧）可能会导致胸痛、咳嗽、呼吸急促和咽部不适。臭氧还可能导致哮喘等一些慢性呼吸疾病恶化，并削弱人体抵抗呼吸道感染的能力。”（参考）他们的研究表明，即使按照制造商说明书来使用，许多产生臭氧的净化器也会导致房子里的臭氧浓度超出健康水平。他们还发现，家用空气净化器所使用的臭氧“对去除室内空气污染物几乎没有任何作用”。他们还指出，臭氧容易和化学物质发生反应，而形成有可能产生更大危害的副产品。
EPA的最终建议是：“公众应使用在实践中证明可行的方法来控制室内空气污染。”而在美国环保局网站上列出的切实可行的方法中，没有臭氧发生器。
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