科学家对于人类诱导多能干细胞（iPSC）与胚胎干细胞（ESC）之间的差异程度，以及两种类型的细胞系之间的差异一直存在着许多争论。日前，由美国科学家研制的一个基于iPSC系和ESC系的定量及具有功能描述能力的评分系统，为细胞系的评估提供了一种实用方法。
在这项研究中，马萨诸塞州剑桥市哈佛大学的Christoph Bock和同事对20个已经建立的人类ESC系以及12个iPSC系进行了全基因组的DNA甲基化绘图，以及基于微阵列的基因图谱表达。就像预期的那样，不同ESC系的遗传和转录状态具有很高的相似性，并且研究人员利用ESC数据计算出了一条“参考通路” ，从而作为对一个多能细胞系中的每个基因的预期基因表达和DNA甲基化水平的一种测量方法。他们随后开始考虑iPSC与ESC到底有多类似。研究人员发现，许多iPSC系的基因表达和甲基化属于在ESC系中观测到的偏差，但总的来说，两种细胞系之间的差异多于每种细胞系之中的差异。
多能细胞系之间的差异具有功能上的意义吗？与之前的研究一样，Bock等人发现，在ESC或iPSC中，基因中的细胞系特定DNA甲基化差异，以及细胞特性的作用，能够改变细胞的分化潜能。
为了使之成为一个能够稳定评估新细胞系有效性的系统，研究人员开发出了一种两步法。第一步，通过一种“差异计分卡”——记录基因的表达和DNA甲基化水平与参考面板进行比较时的异常值——对一个细胞系进行评估。第二步，对细胞系进行一种非定向的分化试验，并且细胞分化成多种细胞系的倾向也被加以计算。这些结果被用来与一个“世系计分卡”——已通过20种对照ESC系进行了校准——进行了比较。研究人员指出，这一评分系统提供了细胞系质量和效用的信息，并且适合扩展到对大量细胞系的筛选工作。研究人员在最近出版的《细胞》杂志上报告了这一研究成果。
研究人员表示，这项研究代表了用系统方法进行干细胞评估的一个进步，并且能够被用来评估产生iPSC的新方法，或者旨在下游应用的细胞的适合性
