但是，走鹅卵石健身也不是人人皆宜。国家体育总局运动医学所的黄光民主任提醒，想通过这种方式健身的人们，一定不能盲目选择，否则健身不成反伤身。脚部有损伤(包括关节胀痛、拉伤、扭伤等)、炎症(包括长骨刺和脂肪垫等)还未痊愈的人，不宜进行走鹅卵石健身。发生过足跟骨疼、脚趾腱鞘炎和囊肿、趾骨骨折连走路都应穿有软垫的鞋来减少摩擦的足病患者，更不宜走鹅卵石，否则可能会加重脚伤。此外，暴露在外的石头上不免沾有灰尘和各种细菌，所以脚部有外伤的人要避免赤脚行走，以防病菌从伤口进入，引起感染。对脚部已有感染的人，像足癣，本身就会导致一些皮肤破损，如果光脚在石头上走，很可能会感染其它病菌，引发一些继发性感染。值得注意的是，即便脚部没病的人，走完之后也应该马上洗脚，否则如果皮肤不留心被擦伤，病菌会马上入侵，造成局部感染、淋巴腺炎、淋巴结肿大等。
患有寒凉性疾病的人，如关节炎和脉管炎等，血管弹性差，受冷刺激后会加剧血管痉挛，使血流更加缓慢，不利于新陈代谢，因此，脚部的保暖非常重要。这类人也不适合赤脚接触冰凉的石头。
患有骨质疏松和骨关节退行性病变的人们应注意控制走鹅卵石的时间。因为，骨质疏松会使跟骨硬度减低，如在坚硬的石头上行走，很容易造成损伤。而骨关节退行性病变则以骨质增生为主，还包括软组织退化(如韧带、关节囊的松弛)和软骨退化，走的时间太久，会加剧磨损，造成膝关节肿胀和疼痛。老年人一般都有不同程度的骨质疏松和关节退行性病变，走鹅卵石的时间应控制在早晚各15分钟左右。黄主任还特别提醒，刚开始走鹅卵石时，脚会比较疼，不应该勉强坚持走很长时间，要循序渐进地增加锻炼时间;早晨鹅卵石较凉，可能会使关节受凉疼痛，应尽量选择接受一天日照后较温暖的鹅卵石路。锻炼后洗完脚，最好用干毛巾把脚擦至发热，这样能够改善微循环。老年人走路时更要将精力集中在路面，以免分散精力造成不必要的扭伤、跌伤。也可以采取站在原地踮脚尖的方式，既安全又起到了和走鹅卵石同样按摩穴位的效果。
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