全基因组关联研究(GWAS)作为定位复杂遗传性疾病易感基因的一种行之有效的方法而备受关注,中国学者利用GWAS已成功获得了海量的遗传学数据,为揭开人类疾病的发病机制奠定了坚实的基础。
中国遗传学研究 获国际同行认可
在中国人群中开展的GWAS迅速增长,中国俨然已经成为世界医学遗传学研究领域的重要成员。首先,作为最大的医学资源市场,中国拥有世界上最庞大的患者群体,有条件进行大规模的基因分型研究。第二,中国目前已积极参与了各项人类基因组工程,如人类基因组计划、国际单体图形计划和千人基因组计划,国际合作促进了世界顶级研究机构的人才和技术交流,极大地推动了GWAS研究。第三,中国人群疾病谱正在悄然改变,如精神类疾病、肿瘤和高血压等慢性病急剧增多,更迫切需要利用GWAS等先进的技术手段,为常见病防治指明方向。
GWAS研究论文 占世界总量8.1%
目前,中国科学家广泛运用GWAS对共28种疾病进行了疾病遗传易感性的研究,占国际总研究病种的17.8%,可分为精神类疾病(如精神分裂症、躁郁症、癫痫)、肿瘤(如肝癌、胃癌、肺癌等)、代谢类疾病(如2型糖尿病、多囊卵巢综合征、骨质疏松症)、心血管疾病(如冠心病、高血压病)、自身免疫性疾病(如Graves病、IgA肾病和强直性脊柱炎)、眼科疾病(如高度近视)、皮肤复杂性疾病(如银屑病、麻风病、白癜风、特应性皮炎)等,共发表超过40篇GWAS研究的文章,占国际发表论文总数的8.1%,其中影响因子在30以上的有27篇。目前共报道了超过120个疾病的易感位点/基因。这些成果离不开国家“863”计划在研究经费方面给予的大力支持。
Graves病是一种以甲状腺功能亢进和出现促甲状腺激素受体抗体为特征的自身免疫性疾病。中国人群GWAS研究在Graves病患者中共发现了6个易感基因位点,使人们对其遗传学发病机制有了更进一步的认识,发现的易感位点还可以作为未来开展疾病基因诊疗的靶标。中国鼻咽癌GWAS发现疾病4个易感基因位点,提示了转化生物因子β和c-Jun N-端激酶信号通路在鼻咽癌发病过程中的重要作用。
中国GWAS研究大大拓宽了人们对常见疾病在遗传学发病机理方面的理解:筛选得到的不同种群间(包含中国种群)共有易感位点可能在疾病发病中发挥更为重要的作用;而不同种群的GWAS研究则揭示了各自的特异性易感位点,强调了不同种群间的遗传异质性,对于提示地域及环境因素影响疾病的发生和发展有重要的研究意义。对中国人群开展更多、更大规模的GWAS研究以及在不同种群间开展平行GWAS研究的比较是至关重要的。
未来努力方向 易感基因功能学研究
在GWAS取得巨大成功的同时,也不能忽略准确鉴定疾病真正致病变异的问题,这就要求投入更多的精力对疾病易感基因位点进行精细定位和功能学研究。当前复杂疾病GWAS研究结果仅能解释小部分的遗传发病风险,在已有的GWAS数据中仍然存在很多有价值的信息,尚需采用新的分析方法,结合基因组学、表观遗传学、转录组学、蛋白质组学和代谢组学等深入挖掘,帮助人们深入理解疾病的发病机理。虽然中国在GWAS研究领域起步较晚,但近几年突飞猛进的发展已紧跟世界发展步伐,并将在后GWAS时代中扮演关键角色。(本报记者冯立中整理)