最近,冰岛的 Helgason 教授等在近期的 Nature Genetics 发表文章,报道了在冰岛居民中 2500 例胃癌病例及 205652 例对照组进行全基因组关联研究的结果。
亚洲人群的全基因组关联研究(genome-wide association syudies,GWAS)已经证实了几个与胃癌风险相关的位点,如 8q24(PSCA)、1q22(MUC1)、10q23(PLCE1)等。欧洲人群中已经检出了前两者,但其他位点尚未在非亚洲人群中得以确定。两项针对美国及波兰的欧洲裔人群进行的研究未能确定胃癌和 PLCE1 位点中 rs2274223 有关。
研究者,对于非编码突变来说,无一达到设定的阈值;但涵盖 MUC1 基因在内的位点 1q22 处突变接近阈值。
p.Gln852 和 p.Ser644 突变导致翻译过程提前终止,使得共济失调毛细血管扩张突变基因(ATM 基因)失活;两种失活性突变超过了预先设定的阈值。但二者不会同时发生,且其各自产生的也是两种不同的胃癌基因型、各自具有其全基因组意义。
ATM 在 DNA 损伤应答方面具有关键性作用,且 ATM 基因中纯合型及杂合型功能缺失突变(包括某些错义突变)会导致毛细血管扩张运动失调综合征。
此前研究表明,ATM 杂合型突变时乳腺癌风险增加,并有证据提示 A-T 综合征及家族中有癌时,相关亲属患结直肠癌、胃癌和胰腺癌风险增加。作者评估了 ATM 功能综合性失活突变与其他 24 种癌之间的联系,发现胰腺癌和前列腺癌与此有关。
临床上,具有 ATM 功能综合性失活突变患者诊断癌时的年龄要比无突变者低,这一点在胃癌表现最显著。在冰岛居住达 50 年以上、1890 年之后出生的居民而言,具有 ATM 功能综合性失活突变者的预期寿命要短于无突变者。
为评估 ATM 基因中功能失活突变的致病性,作者还检测了这些突变在冰岛 A-T 病例中的情况。1 例 A-T 中可见 p.Tyr103 和 p.Arg457 综合型杂合突变,第 2 例 A-T 中则发现 p.Gln852 纯合性突变。此前还报道过 1 例 A-T 中 p.Ser644 失活突变。
该研究证实,ATM 基因在欧洲人群中也是一个胃癌的高危基因。