5月29日凌晨1点40分，病毒病所收到广东省疾控中心送检的病例咽拭子标本，5点40分完成核酸检测。6月1日完成24kbp的基因序列测定，并将全部结构蛋白与附属蛋白编码基因的序列上传至GenBank数据库。6月3日凌晨，采用高通量测序方法，完成了病毒30.1Kbp的全基因组序列测定，并于当天上传至GenBank数据库。
序列分析结果表明，该病毒与当前中东地区MERS-CoV流行株高度同源，根据遗传学相关分析，初步推测该毒株最终可能来源于中东地区的沙特阿拉伯。S蛋白编码基因与GenBank上已有的86条全基因组核苷酸同源性为98.9%-99.6%，但与病毒感染有关的受体结合区没有发现突变，其他结构蛋白基因与附属蛋白基因也高度保守。目前尚未发现与病毒传染性增强相关的明显证据，对于病毒基因组上少量的基因变异和重组的生物学意义正在进一步分析。
