许多基因单位结合起来形成基因模块,这些模块共同起作用会产生特异性功能,体现不同肿瘤的特征。但是9月26日出版的《自然遗传学杂志》上的一项研究结果表明,相同模块会与多种不同的临床疾病有关。
马萨诸塞州哈佛大学的Aviv Regev博士表示,研究这些模块的特征会有助于将微矩阵分析和临床结合起来。帮助癌症基因组研究者找到癌症诊断或者治疗的新的靶位基因。
Regev博士及其同事早已开始分析代表22种肿瘤类型的将近2000个DNA微矩阵。他们从中找到了456个统计学上明显不同的模块,代表不同的过程和功能,包括代谢、转录、翻译、降解、细胞和神经信号、生长、细胞周期、凋亡、细胞外基质、细胞骨架成分。然后根据模块组合定义临床情况。
接下来他们构成了癌症的全球模块地图,显示一些模块是肿瘤类型特异性的。例如,血液肿瘤有类似的免疫、炎症、生长调节、信号模块,特异模式的模块可以区分不同肿瘤类型。
有一些模块可见于多种肿瘤类型,提示有共同的肿瘤进展机制。一个重要的例子是骨母细胞模块,与骨形成细胞的增殖和分化有关,在乳腺癌、肺癌、肝癌、白血病的骨转移中起重要作用。
Regev博士使用抗白血病药物格列卫来说明模块地图如何应用时表示,格列卫的靶位是一个众所周知的蛋白,因此我们能够观察到这个蛋白出现什么变化。这种蛋白属于哪种模块呢?所属模块与多种不同种类癌症的相关性如何?那种信息依次提示其他癌症可能是这种药物的一个相关靶位。
Regev博士指出,科学家们能够浏览感兴趣的基因或者模块,或者是他们正在研究的临床疾病。
研究小组还公布了他们使用的软件。Regev博士认为,这是一种非常快速的工具,并且界面友好。不需要用户了解如何编程,并且可以重复他们全部资料