知名癌症研究所:Dana-Farber癌症研究所中心,Broad研究院与454生命科学有限公司(454 Life Sciences Corporation)(Nasdaq: CRGN)的研究人员在Nature Medicine网络版杂志上联合发表了一种在目前癌症基因极度低水平变异检测方面的新方法,这种454新方法可以在分子水平上识别稀少的癌症相关联遗传突变,可能是一种潜在的个性化治疗方法。
目前我们知道遗传突变使得一些肿瘤细胞对化疗(chemotherapy)产生反应,但是有一些突变却导致肿瘤细胞对药物治疗产生抵抗。从历史上来看,癌症研究一直被肿瘤样品中细胞复合成份阻碍着发展脚步,而这一方面很大的一个困难就是传统的,高成本低效率测序方法。在之前的Nature杂志上454公司提出了一种高效低成本高通量的测序方法,可以快速的对整个基因组进行测序。
研究人员从22个肺癌病患身上取得了肿瘤样品,分析其表皮生长因子受体(Epidermal Growth Factor Receptor,EGFR)五个外显子的突变——EGFR基因是几个新抗癌药物(EGFR抑制剂)的靶标。这项调查结果表明454测序方法也许可以使得EGFR突变成为病患EGFR抑制剂治疗效果的预测方法。
Dana-Farber癌症研究所中心的Matthew Meyerson博士认为,“肿瘤DNA分析十分复杂,因为病患样品中肿瘤细胞的数量参差不齐,而且许多肿瘤的异源本质导致很难实现肿瘤DNA的精确测序,而这个证实在个性化治疗当中所需要的”,“454公司的这种方法也许是解决异源癌症样品分子诊断,以及实现为病人筛选目标癌症治疗方法的手段之一。”这一项技术同时也被应用到了其它研究所,J. Craig Venter研究所人类基因组医学部主任Robert Strausberg也说,“我们已经在目标基因医学测序上应用了454测序方法。”
有关测序的话题实际上随着各种测序方法的进步已经有了许多突破性的进展,见谁是测序技术大玩家?