英国研究人员日前报告说，人类基因组中一些“垃圾DNA”产生的物质与乳腺癌等癌症存在相关性，这项发现有助于研发新的癌症治疗方法。
英国诺丁汉大学等机构研究人员在美国《基因组学》杂志上报告说，他们发现人类基因组中名为L1的DNA序列会导致生成一些反常产物，而这些产物多见于乳腺癌细胞中。
DNA即脱氧核糖核酸，它可以组成遗传指令，指导细胞合成蛋白质等物质。据介绍，序列L1常被称为“垃圾DNA”，因为它是人体内的非编码DNA，不像编码序列那样指导合成特定蛋白质。但研究人员在乳腺癌和肠癌细胞中发现了序列L1导致生成的反常产物，因此上述癌症可能与L1等“垃圾DNA”功能异常有关。
研究人员指出，序列L1携带一个“开关”，可以随机开启附近基因，如果这些基因被不适当地启动，就会生成反常产物，对细胞正常功能造成影响。通常，正常细胞中都有抑制这个“开关”的化学物质，但在一些癌细胞中，这些抑制物质却消失了。研究人员正试图确定，是一些“垃圾DNA”的上述特殊“开关”启动导致了癌症，还是癌症导致该“开关”启动。但无论如何，这些“垃圾DNA”至少可以成为癌症治疗中有用的指示物。
领导这项研究的诺丁汉大学博士克里斯蒂娜·图法雷利说，如果进一步研究确认一些“垃圾DNA”真的在癌症生成中扮演某种角色，那么将提供一种了解癌症的新机制，有助于研发新的癌症治疗方法。（生物谷Bioon.com）
垃圾DNA相关研究：
PLoS Genetics：发现垃圾DNA对基因调控的作用
Science：“垃圾DNA”在基因组中的重要功能
Nature：发现一类新的小RNA分子
Genome Research：“垃圾基因”影响物种进化
Science：非编码DNA有可调控基因剪切
生物谷推荐原始出处：
Genomics December 2009 doi:10.1016/j.ygeno.2009.08.013
Isolation of cancer-specific chimeric transcripts induced by hypomethylation of the LINE-1 antisense promoter
Hazel A. Cruickshanksa, b and Cristina Tufarelli, a, b,
aWolfson Centre for Stem Cells, Tissue Engineering and Modelling (STEM), Centre for Biomolecular Sciences, University of Nottingham, Nottingham, NG7 2RD, UK
bDepartment of Genetics, University of Leicester, Leicester, LE1 7RH, UK
The antisense promoter of human LINE-1 (L1) retroelements can direct transcription of adjacent unique genomic sequences generating chimeric RNAs, which can perturb transcription of neighbouring genes. As L1 elements constitute 17% of the human genome, chimeric transcription is potentially widespread, but the extent to which this occurs is largely unknown. Using a genome-wide screen we have isolated novel chimeric transcripts that are unique to breast cancer cell lines, primary tumours and colon cancer cells. Expression of the cancer-specific chimeric transcripts can be induced in non-malignant breast epithelial cells by the demethylating drug 5-azacytidine. These findings indicate that loss of L1 methylation in cancer cells is linked to the expression of L1-chimeric transcripts which may therefore constitute a useful set of markers of malignancy.
