近日来自南京医科大学、中国医学科学院北京协和医院、上海交通大学、华中科技大学、复旦大学、中国医科大学、广州医学院等研究机构的科研人员通过全基因组关联研究(GWAS),在中国汉族人群中鉴定出了与肺癌相关的两个新位点。这一研究成果在线刊登在6月3日的《自然—遗传学》(Nature Genetics)杂志上。
领导这一研究的是南京医科大学特聘教授、公共卫生学院院长沈洪兵,其早年毕业于南京医学院卫生系,后曾作为高级访问学者赴美国德克萨斯大学安德森癌症中心流行病学进行肿瘤分子流行病学研究。近年来主要的研究领域为肿瘤、糖尿病、高血压等慢性病的流行病学和分子流行病学研究,并在肿瘤的早期诊断、遗传易感性和复发、预后的分子标志等方面取得了较突出的成绩,已发表SCI论文150余篇,包括肿瘤学一线期刊J Clin Oncol、J Clin Invest、Cancer Res等。
肺癌是世界范围内最常见的癌症,属于多基因疾病,即多个基因的变异共同参与发病。研究表明携带基因变异的个体比非携带者具有更高的患病风险性,故将这些基因称为“易感基因”。吸烟是肺癌的主要危险因素,但吸烟人群中有80%以上的个体不会罹患肺癌,而非吸烟者中仍有10-15%的肺癌患者,说明个体对肺癌的遗传易感性存在差异。目前国际人类基因组计划 (human genome project, HGP)的测序完成和单核苷酸多态(single nucleotide polymorphism, SNP)的单体型图谱构建完成,为肺癌遗传易感性的研究提供了大量的数据支持,同时经济高效的高通量基因分型技术在一个反应内可以同时检测上千个SNPs,使得在全基因组范围内筛选与肺癌相关的SNPs成为可能。
在这篇文章中,研究人员首先对5408名受试者(其中包括2331名肺癌患者,以及3077名未患该病的对照个体)进行了全基因组关联分析。在随后的研究中进一步对另一组12722名受试者(其中包括6313名肺癌患者,以及6409名对照个体)进行了检测,他们鉴定出了4个与肺癌相关联的风险位点,其中13q12.12 和22q12.2为在汉族人群中发现的新的风险位点。
这一研究发现为我国今年肺癌研究领域取得的重要成果之一,它将帮助科学家们更深入地了解汉族人群肺癌发生的分子机制,探索肺癌风险预测,并为未来肺癌的诊断、治疗、新药研发提供了新的靶点。(生物谷Bioon.com)
生物谷推荐原文出处:
Nature Genetics DOI: doi:10.1038/ng.875
A genome-wide association study identifies two new lung cancer susceptibility loci at 13q12.12 and 22q12.2 in Han Chinese
Zhibin Hu; Chen Wu; Yongyong Shi; Huan Guo; Xueying Zhao; Zhihua Yin; Lei Yang; Juncheng Dai; Lingmin Hu; Wen Tan; Zhiqiang Li; Qifei Deng; Jiucun Wang; Wei Wu; Guangfu Jin; Yue Jiang; Dianke Yu; Guoquan Zhou; Hongyan Chen; Peng Guan; Yijiang Chen; Yongqian Shu; Lin Xu; Xiangyang Liu; Li Liu; Ping Xu; Baohui Han; Chunxue Bai; Yuxia Zhao; Haibo Zhang; Ying Yan; Hongxia Ma; Jiaping Chen; Mingjie Chu; Feng Lu; Zhengdong Zhang; Feng Chen; Xinru Wang; Li Jin; Jiachun Lu; Baosen Zhou; Daru Lu; Tangchu
Lung cancer is the leading cause of cancer-related deaths worldwide. To identify genetic factors that modify the risk of lung cancer in individuals of Chinese ancestry, we performed a genome-wide association scan in 5,408 subjects (2,331 individuals with lung cancer (cases) and 3,077 controls) followed by a two-stage validation among 12,722 subjects (6,313 cases and 6,409 controls). The combined analyses identified six well-replicated SNPs with independent effects and significant lung cancer associations (P < 5.0 × 10?8) located in TP63 (rs4488809 at 3q28, P = 7.2 × 10?26), TERT-CLPTM1L (rs465498 and rs2736100 at 5p15.33, P = 1.2 × 10?20 and P = 1.0 × 10?27, respectively), MIPEP-TNFRSF19 (rs753955 at 13q12.12, P = 1.5 × 10?12) and MTMR3-HORMAD2-LIF (rs17728461 and rs36600 at 22q12.2, P = 1.1 × 10?11 and P = 6.2 × 10?13, respectively). Two of these loci (13q12.12 and 22q12.2) were newly identified in the Chinese population. These results suggest that genetic variants in 3q28, 5p15.33, 13q12.12 and 22q12.2 may contribute to the susceptibility of lung cancer in Han Chinese.