目前,圣路易斯华盛顿大学医学院的研究团队于Nature Genetics杂志线发表了他们最新研究成果"Recurrent mutations in the U2AF1 splicing factor in myelodysplastic syndromes",研究人员已经从一些骨髓异常增生综合征患者身上找到一个关键的基因突变,具有这些突变的患者更宜于患急性白血病。虽然该结果尚需经额外患者证实,但该研究了提出了遗传检测能更准确诊断这类疾病并预测病程的前景。
科学家通过对1例骨髓增生异常综合征进展至白血病的65岁男性患者进行全基因组测序并与其肿瘤细胞基因组比对,发现U2AF1 基因存在一处突变。还发现 其他骨髓增生异常综合征患者中亦存在这种遗传错误,提示该突变有意义。
“该基因突变不属于任何筛查网络,”资深作者——血液/肿瘤科医学副教授Matthew Walter, MD说。“多数骨髓增生异常综合征病例因缺乏直接诊断试验而诊断不明。我们希望通过于遗传水平了解促进该病的因素,能最终改善该病的诊疗。”
骨髓增生异常综合征属于血液肿瘤家族,治疗困难,见于骨髓中血细胞成熟障碍时。每年约28000例美国人诊断出患有该病,多数在60岁以上。有用于该病的药物,但均无法治愈。
约30%的病例进展至急性髓系白血病,化疗无效,常为致命性。当前医生通过观察肿瘤细胞内染色体的重排与分裂程度(该病严重程度的预测指标),来评价骨髓增生异常综合征患者进展至白血病的可能性。
“染色体型可提示高危与低危,但当前确定疾病进展的方法并不完美,”第一作者——医学副教授Timothy Graubert, MD说,Timothy Graubert擅长于骨髓增生异常综合征患者的治疗。
全基因组测序鉴定出3例患者中的U2AF1 突变后, 研究人员检测了该突变基因在另外150例骨髓增生异常综合征患者的状态。鉴定出13例突变,约9%。突变于骨髓增生异常综合征发生过程中获得,因为每例患者的正常细胞中不存在该突变。
U2AF1 基因突变者发生白血病的机率约高达无该突变者的3倍。U2AF1 基因突变者中15.2%的患者进展至白血病,无该突变者中为5.8%。
最常见的突变导致U2AF1 基因精确部位DNA上单个碱基置换。有遗传错误的患者最易发生丝氨酸被苯丙氨酸或酪氨酸替代。研究人员称该突变本身并不引起骨髓增生异常综合征,而是作为该病病程中的早期事件。
正常 U2AF1 基因表达涉及RNA(DNA的姐妹分子,指导蛋白翻译)剪接的一种蛋白。剪接将蛋白翻译所需的RNA不同部位拼接在一起,去除不需要的部分。突变基因仍能翻译蛋白,但其剪接活性改变,可能对某些肿瘤的发生很重要。
该新研究受联邦促进基金资助,增加了关于骨髓增生异常综合征遗传基础的仓促新发现。《自然》与《新英格兰医学杂志》上发表的近期研究与当前研究一道鉴定出骨髓增生异常综合征患者中8个涉及RNA剪接的基因中的突变。
“总之,这些发现是真正的变革者,”Graubert说。“高达50%的骨髓增生异常综合征患者存在这8个基因中的突变。因为这些变化如此常见,我们认为可能有助于改善该病的诊断与发现新治疗策略。”(生物谷Bioon.com)
doi:10.1038/ng.1031
PMC:
PMID:
Recurrent mutations in the U2AF1 splicing factor in myelodysplastic syndromes.
Graubert TA, Shen D, Ding L, Okeyo-Owuor T, Lunn CL, Shao J, Krysiak K, Harris CC, Koboldt DC, Larson DE, McLellan MD, Dooling DJ, Abbott RM, Fulton RS, Schmidt H, Kalicki-Veizer J, O'Laughlin M, Grillot M, Baty J, Heath S, Frater JL, Nasim T, Link DC, Tomasson MH, Westervelt P, Dipersio JF, Mardis ER, Ley TJ, Wilson RK, Walter MJ.
Myelodysplastic syndromes (MDS) are hematopoietic stem cell disorders that often progress to chemotherapy-resistant secondary acute myeloid leukemia (sAML). We used whole-genome sequencing to perform an unbiased comprehensive screen to discover the somatic mutations in a sample from an individual with sAML and genotyped the loci containing these mutations in the matched MDS sample. Here we show that a missense mutation affecting the serine at codon 34 (Ser34) in U2AF1 was recurrently present in 13 out of 150 (8.7%) subjects with de novo MDS, and we found suggestive evidence of an increased risk of progression to sAML associated with this mutation. U2AF1 is a U2 auxiliary factor protein that recognizes the AG splice acceptor dinucleotide at the 3' end of introns, and the alterations in U2AF1 are located in highly conserved zinc fingers of this protein. Mutant U2AF1 promotes enhanced splicing and exon skipping in reporter assays in vitro. This previously unidentified, recurrent mutation in U2AF1 implicates altered pre-mRNA splicing as a potential mechanism for MDS pathogenesis.