德国蒂宾根大学马克斯普朗克发育生物学学会的研究员确定了一种由寄生虫遗传因素编码并引起流动性的蛋白质结构（L1ORF1p）。被称为LINE-1的反转录转座子是一种可以繁殖并能在不同方位插入染色体DNA中的移动遗传因素。这就会打乱融合的遗传密码，由此对宿主生物体带来严重后果。
另一方面，这也会引起遗传变异，这也是物种进化的先决条件。现在L1ORF1p蛋白质的结构有利于对LINE-1移动机制做出更精确的学术研究。这就为反转录转座子和反转录病毒的关系提供了新视角，也可能为人类和动物的某些进化过程提供了新视角。研究员甚至认为在未来的某一天，利用LINE-1反转录转座子就可以将遗传信息准确地插入某些特定的位置。对于当代基于反转录病毒机制、具有更少确定方位的方法来说，这将是另一种选择。
LINE-1反转录转座子是一种在人类基因史上成倍增长的移动基因。目前，约17%的人类基因由LINE-1序列组成。如果考虑到大约30000个人类蛋白质分子是由不到5%的DNA编码的话，这就是一个很大的比例了。LINE-1反转录转座子不仅自身增殖，还负责100万个阿尔哈诺夫序列（另一种寄生虫基因）基因的整合。阿尔哈诺夫序列只存在于高等灵长类体内，同时，占据了我们基因组的10% 。LINE-1和阿尔哈诺夫序列地插入是一个持续的过程。大约每20个新生儿中至少包含了一个这种元素的插入。
因此，几乎没有人类基因不受LINE-1融合的影响。领导马克斯普朗克发育生物学学会科研人员的奥利弗（Oliver Weichenrieder）说：“很难相信LINE-1和阿尔哈诺夫序列的大规模融合没有对人类进化造成影响。然而令人惊讶的是，到目前为止我们对包含在这一进程中的反转录转座子机制，蛋白质和核酸所知甚少。”因此，研究员尝试通过参与分子的生化特性及其分子结构的确定寻找新的视角。这就为详细的功能分析和已知蛋白质相似性的提示，特别是在各自氨基酸的简单比较中不显著的相似性提供了基础。
由人类LINE-1反转录转座子编码蛋白质有两种。在艾琳娜莫（Elena Khazina）和奥利弗（Oliver Weichenrieder）近期发表的著作中，他们描述了其中一种蛋白质的特征。这种所谓的L1ORF1p蛋白质能和由基因组中LINE-1元素转录而成的LINE-1核糖核酸结合。因此，L1ORF1p能支持随后的LINE-1核糖核酸向DNA的反转录。这一进程发生在新LINE-1元素的基因融合过程中。
研究员表明L1ORF1p蛋白质由三部分组成。第一部分会引起自缔合（self-association），三个分子聚集形成三聚体。其他两个部分是合成LINE-1核糖核酸的必要因素。艾琳娜莫（Elena Khazina）说：“最让人吃惊的是在蛋白质中部的一种所谓的RRM域（RRM-domain）的定义。晶体的结构明确地证实了这种域的存在。同时，我们在大量人类和动物的其他反转录转座子中也证明有这种RRM域（RRM-domain）。” RRM域（RRM-domain）通常出现在细胞中，特别是在结合了核糖核酸的蛋白质中。
目前，L1ORF1p里RRM域（RRM-domain）的存在解释了为什么L1ORF1p会与LINE-1核糖核酸结合，以及这种情况具体是怎样发生的。对L1ORF1p蛋白质结构的深入了解为日后细胞进程的调查提供了一个新视角和一个好的基础。即，为被LINE-1元素的繁殖所利用的细胞进程的调查提供了一个新视角和一个好的基础，也为可以防止反转录转座子过度繁殖的机制细胞进程的调查提供了一个新视角和一个好的基础。（生物谷Bioon.com）
生物谷推荐原始出处：
PNAS January 20, 2009 vol. 106 no. 3 731-736 doi: 10.1073/pnas.0809964106
Non-LTR retrotransposons encode noncanonical RRM domains in their first open reading frame
Elena Khazina and Oliver Weichenrieder1
Department of Biochemistry, Max Planck Institute for Developmental Biology, Spemannstrasse 35, 72076 Tübingen, Germany
Non-LTR retrotransposons (NLRs) are a unique class of mobile genetic elements that have significant impact on the evolution of eukaryotic genomes. However, the molecular details and functions of their encoded proteins, in particular of the accessory ORF1p proteins, are poorly understood. Here, we identify noncanonical RNA-recognition-motifs (RRMs) in several phylogenetically unrelated NLR ORF1p proteins. This provides an explanation for their RNA-binding properties and clearly shows that they are not related to the retroviral nucleocapsid protein Gag, despite the frequent presence of CCHC zinc knuckles. In particular, we characterize the ORF1p protein of the human long interspersed nuclear element 1 (LINE-1 or L1). We show that L1ORF1p is a multidomain protein, consisting of a coiled coil (cc), RRM, and C-terminal domain (CTD). Most importantly, we solved the crystal structure of the RRM domain, which is characterized by extended loops stabilized by unique salt bridges. Furthermore, we demonstrate that L1ORF1p trimerizes via its N-terminal cc domain, and we suggest that this property is functionally important for all homologues. The formation of distinct complexes with single-stranded nucleic acids requires the presence of the RRM and CTD domains on the same polypeptide chain as well as their close cooperation. Finally, the phylogenetic analysis of mammalian L1ORF1p shows an ancient origin of the RRM domain and supports a modular evolution of NLRs.
