来自于最近SCIENCE的文章,本期SCIENCE的主题就是biological imaging,本文则是探讨如何将生物信息学技术应用于这项工作中去的开拓性文章,相信对大家会有启发。
生物显像(Biological imaging)技术现在是探测细胞结构和动态的重要的数量分析工具,并且被越来越多的用于基于细胞的扫描(cell-based)工作。然而,对应的进行数据图象分析工作的生物信息学工具还不成熟。
本文的作者发展了一种名为Open Microscopy Environment (OME)的系统,作为显微图象存储和分析的信息学工具。OME的目标是自动化图象分析、建模,在大量图象中进行数据整理、发掘工作。OME系统采用弹性的数据模型,关系数据库和以XML编写的文档,这使得OME可以很容易与其他软件工具进行整合。作者认为,通过这样的设计,OME使得显像信息学的发展迈出了重要的第一步。