生物过程非常复杂，需要利用到各种高科技技术，也就是称为“omics（组学）”的技术工具，这些方法能进行细胞中成千上万个分子的整体分析，并且追踪它们在疾病中作用。
在后基因组时代，研究人员发现细胞整体蛋白，也就是蛋白质组学研究需要提到到一个新的层面，由于蛋白是基因的分子执行者，因此如果我们希望能更全面了解细胞的工作机制，就需要找到这个最找到的拼图。
西班牙国家癌症研究中心Javier Munoz与荷兰乌得勒支大学，以及荷兰蛋白质组学研究中心的研究人员在1月18日公布的Nature Review Genetics杂志上，进行了蛋白质组学研究领域的最新技术的修订，这些技术包括生物学样品制备中的技术进展，质谱技术创新，以及生物信息学数据分析的发展。
为了介绍这些技术进展，作者参考了新一代基因组测序技术，将其命名为“新一代蛋白质组学”，并且这些研究人员还通过了几个蛋白质组学研究的例子，解析了几种生物医药研究方案中的关键数据。
在这一修订版最后，作者强调了这些研究在临床操作中的主要应用，比如寻找有用的新生物标志物，改进癌症的诊断和预后判断，或者在分析了需要研究的细胞数量后，设计患者的个体化治疗方法。(生物谷Bioon.com)
doi:10.1038/nrg3356
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Next-generation proteomics: towards an integrative view of proteome dynamics
A. F. Maarten Altelaar, Javier Munoz & Albert J. R. Heck
Next-generation sequencing allows the analysis of genomes, including those representing disease states. However, the causes of most disorders are multifactorial, and systems-level approaches, including the analysis of proteomes, are required for a more comprehensive understanding. The proteome is extremely multifaceted owing to splicing and protein modifications, and this is further amplified by the interconnectivity of proteins into complexes and signalling networks that are highly divergent in time and space. Proteome analysis heavily relies on mass spectrometry (MS). MS-based proteomics is starting to mature and to deliver through a combination of developments in instrumentation, sample preparation and computational analysis. Here we describe this emerging next generation of proteomics and highlight recent applications.
