对人类转录体的大量创新性的分析,提高了目前被认为是在基因间的基因组区域产生大量转录物的可能性。
随着人类基因组测序的完成,以及密度不断增加的新型芯片被引入到应用中,人们逐渐能够对基因组开展大规模的分析工作了。但是令人惊奇的是,在Affymetrix 公司的Thomas Gingeras研究小组,最近在《科学》杂志上发表了一篇研究论文,他们雄心勃勃地宣称在对5—核苷进行分解的基础上,己经完成了对10个人类染色体转录物的作图工作。
这一分解作用增加了检测短的转录物的可能性,并且该分解作用是通过将25—核苷探针设计成瓦状排列完成的,在10个染色体的无重复系列中,该探针以每5个碱基对为间隔。该研究小组用98个芯片组成大约7400万个探针对,检测了大约30%的人类基因组。他们对来自于8个不同细胞系的胞质多聚腺苷酸RNA进行了分析,并对其中一个细胞系的细胞质和细胞核的多聚(A)+和多聚(A)-的转录物进行了深入研究。
根据获得的令人疑惑的分析结果,该研究小组推断,尽管大多数被检测到的胞质多聚(A)+转录物在基因组区作图时,外显子和基因含量很高,但它们中的大约30%似乎来自于目前未知的基因组区。通过5’和3’ RACE(cDNA末端快速扩增)以及cDNA克隆,在对这些转录物的随机片段进行结构分析之后,研究小组认为DNA双链都被转录是很正常的现象。出人意料的不仅仅是多聚(A)-转录物如此之多,而且研究小组估计,这些转录物可能占人类转录体的一半,它们可能同样来自于目前已知的区域和基因间区域。
许多研究者认为,目前对人类基因组的深入研究尚未完成,并且最近有不少报道指出,人类基因组可能存在更多基因。但是随着目前研究的进行,人们推断转录区域的实际范围超出了以前的预测范围。这一惊奇的发现提出了许多问题,虽然芯片研究结果仅仅是个开始而并非最终的答案,但是未来对生命起源和大量新转录物的生物功能的研究,一定会带来令人激动的新发现。
REFERENCES
Genove, G. et al. A new transgene reporter for in vivo magnetic resonance imaging. Nat. Med., 11, 450?454 (2005). | Article | PubMed | ChemPort |