9月4号Nature Genetics杂志上的发表了Johns Hopkins University School of Medicine(约翰霍普金斯大学医学院)的科学家的重要研究成果:人类胚胎干细胞连续培养时会出现基因组变异!通过对大约包含115,000单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms,SNP)的寡核苷酸芯片的分析,发现在4个新传代的株系中会发生基因拷贝数的变化,包括大基因组的扩增或丢失,比如整个17q染色体的扩增;还有个别的变化,比如在MYC致癌基因周围的2Mb(megabase)的扩增。另外也发现在两个新传代的株系中,线粒体DNA的编码序列有5处发生了变化,其中3处导致1,2,4-NADH脱氢酶编码区错义突变,另一处引起ATPase6的无义突变。之后研究人员利用实时荧光定量甲基化特异PCR(Real-time quantitative methylation-specific PCR assays)技术,对14个癌症组织中已知差异性甲基化(differential methylation)基因进行分析,结果表明在8个新传代株系启动子均有了更高的甲基化水平。
美国国立卫生研究院干细胞研究组主任James Battey认为,这一新发现非常有意义,它告诫我们需要警惕这些细胞,尤其是进行长期传代时。虽然如此,研究人员也注意到用早期传代株系(early-passage lines)可以部分解决这一问题,进一步的确证还需要更多的实验,要更深入了解这些变化会有怎样的表现型。
原文出处
Maitra A, Arking DE, Shivapurkar N, Ikeda M, Stastny V, Kassauei K, Sui G, Cutler DJ, Liu Y, Brimble SN, Noaksson K, Hyllner J, Schulz TC, Zeng X, Freed WJ, Crook J, Abraham S, Colman A, Sartipy P, Matsui SI, Carpenter M, Gazdar AF, Rao M, Chakravarti A.Genomic alterations in cultured human embryonic stem cells.
Nat Genet. 2005 Sep 4 PDF文件下载