生物谷报道：器官如何发挥功能？至少从蛋白质组学水平上认为这与蛋白质间相互作用网络有很大的关系，了解人类细胞内蛋白质相互作用网络图谱有助于人类更深认识了蛋白质组学在功能性器官中的价值。在9月1日出版的电子版Cell上，德国海德堡的科学家报道这一最新进展。这一研究成果是首次大规模研究人类蛋白质间相互作用的实验，这一研究成果不仅为今后大规模研究人类不同的细胞组分（如线粒体，细胞膜，细胞核等）的蛋白质间相互作用提供了技术支持，也提供了可参照模型，这将大大失推动了人类对蛋白质组学网络的认识。而且随着研究的深入，蛋白质间相互作用的图谱逐渐揭示，生物信息学的不断发展，将带到生命科学领域的巨大变革！
为系统检测人类蛋白质间相互作用，采用了4456个诱饵蛋白和5632个猎物蛋白，采用酵母双杂交方法进行研究。结果，在1705种蛋白质间之间确定了3186种新的相互作用关系。同时采用免疫共沉淀和Pull-down验证了这一结果。再通过拓扑学等评价，至少在401种蛋白质间有911种相互作用联系，是十分可信的，在评估中得分很高。
进一步研究这些蛋白质间相互作用与人类疾病的关系。发现了至少两个新的与Axin-1相互作用的蛋白质ANP32A和CRMP1能够调节Wnt信号通路，从而影响了发育，肿瘤等。虽然这仅仅筛选了这两个新蛋白，但可以肯定的是，这篇研究成果中包含有大量的重要信息有待更深入地发掘，相信能带来更多有价值的信息。下面是蛋白质间相互作用的网络图谱的示意图：
(A) A graph of the HC interaction network involving 401 proteins linked via 911 interactions. Orange: disease
proteins (according to OMIM morbidmap, NCBI); light blue: proteins with GO annotation; yellow: proteins without
GO and disease annotation. Interactions connecting the nodes are represented by color-coded lines according to their
confidence scores. Green: 3 quality points; blue: 4 quality points; red: 5 quality points; purple: 6 quality points.
(B) Y2H proteins linked to the Wnt signaling pathway. Spheres: proteins annotated in the KEGG regulatory pathway
(blue); proteins with high-confidence Y2H interactions (light blue); proteins with MC or LC PPIs (white). Links:
protein-protein relations annotated in the Wnt pathway (brown); PPIs from HPRD (black); Y2H HC PPIs (red); Y2H
LC and MC PPIs (gray). The proteins CRMP1, ANP32A, and KIAA1377 bridge two proteins in the Wnt pathway.
生物谷专家认为，随着功能蛋白质组学的研究不断深入，更多的蛋白质间相互作用网络被揭示，更多地蛋白质间相互作用形成新的网络信号通路，信号通路网络交织在一起就构成了细胞的真实生命图景。将来的系统生物学将逐步揭示这些复杂相互作用的最终奥秘。
原文来源：
Stelzl et al. A Human Protein-Protein Interaction Network: A Resource for Annotating the Proteome. Summary] [Supplemental data] [PDF全文下载]
(全文解压缩密码www.bioon.com)
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