近年来，许多研究已经揭示出垃圾DNA事实上具有重要的功能，随着研究的深入，人们必定会发现越来越多的垃圾DNA决非垃圾，而是基因组的宝贵财富。
约翰霍普金斯医学院的McKusick-Nathans基因医学研究所的研究人员发明了一种相当符合效益及非常有效率的分析方法，该方法可用于分析垃圾DNA的功能，并且确定出对于这些基因功能十分重要的区域。研究人员还发现，在不同的物种中，这些控制区域的功能不尽相同。该研究结果发表在3月23日的Science Express上。
研究人员开发出一种新方法，可利用斑马鱼胚胎测试哺乳动物的启动子DNA和鉴定出启动子DNA序列的新系统。
由于启动子位于占人体非编码蛋白质的98％的基因组组分中，所以不编码蛋白质的DNA 序列（也就是所谓的垃圾DNA）很少遵循组织规则和序列模式，因此加大研究难度。
研究人员利用这个新系统研究了与神经节细胞缺失症(Hirschsprung 病) 和多发性内分泌瘤(MEN2)有关的基因RET，并且确定出用标准方法无法鉴别出的可控制RET 的DNA 序列。
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