2012年8月14日 讯 /生物谷BIOON/ --在一项新研究中，研究人员利用一种比之前的技术强大100多倍的技术来追踪研究全基因组关联结果。这种被称作代谢芯片(Metabochip)的技术是被设计作为一种低成本高效益的方法来大规模地寻找和绘制与一系列与心血管特征和代谢特征相关联的基因组区域。之前的方法每次只能测试30到40个与不同特征相关联的DNA序列变异，然而，这种代谢芯片允许研究人员每次能够研究高达20万个与不同特征相关联的DNA序列变异。研究人员希望找到新的影响血液中葡萄糖和胰岛素特征的序列变异，和鉴定出参与胰岛素和葡萄糖水平调节的途径。
研究人员在早前的研究中，鉴定出23个与血糖水平相关联的基因区域，从而突出表明重要的生物途径参与葡萄糖调节。
在这项研究中，研究人员将利用代谢芯片检测新样品时获得的数据与来自之前的研究中的数据结合起来，以便发现与血液中葡萄糖和胰岛素水平相关联的基因区域，结果他们鉴定出38个之前未知的基因区域：它们参与调控3种不同的数量性状(quantitative trait)，其中这些性状与血糖水平、空腹葡萄糖浓度、空腹胰岛素浓度和饭后葡萄糖浓度相关联。这些发现有助于研究人员研究影响胰岛素水平和其他代谢特征的基因组区域之间的重叠情况。研究人员观察到他们鉴定出的基因组区域与与腹部肥胖和不同脂质水平相关联的基因组区域存在一定的重叠。
研究人员还发现更多的并不那么显著的基因区域可能与血液中葡萄糖和胰岛素水平相关联，但是当前没有获得数据来明确地确定它们在全基因组范围是显著性的。这项发现支持着之前的证据：很多其他的基因区域即便是全部加在一起也只能产生非常小的遗传效应，但是可能增加患上诸如糖尿病之类的疾病的风险。总之，这些并不显著的全基因关联可能代表着重要的关于血液中葡萄糖和胰岛素水平上的关联。(生物谷Bioon.com)
本文编译自Metabolic MAGIC: Meta-analyses reveal new genetic regions influencing blood glucose traits
doi: 10.1038/ng.2385
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Large-scale association analyses identify new loci influencing glycemic traits and provide insight into the underlying biological pathways
Robert Scott, Vasiliki Lagou, Ryan P. Welch et al
Through genome-wide association meta-analyses of up to 133,010 individuals of European ancestry without diabetes, including individuals newly genotyped using the Metabochip, we have increased the number of confirmed loci influencing glycemic traits to 53, of which 33 also increase type 2 diabetes risk (q < 0.05). Loci influencing fasting insulin concentration showed association with lipid levels and fat distribution, suggesting impact on insulin resistance. Gene-based analyses identified further biologically plausible loci, suggesting that additional loci beyond those reaching genome-wide significance are likely to represent real associations. This conclusion is supported by an excess of directionally consistent and nominally significant signals between discovery and follow-up studies. Functional analysis of these newly discovered loci will further improve our understanding of glycemic control.
