由深圳华大基因研究院、深圳市第二人民医院（简称市二院）等单位组成的科研团队，通过对99个膀胱癌患者样本进行全基因组及全外显子测序研究，发现了与姐妹染色单体结合及分离（sister chromatid cohesion and segregation, SCCS）相关的基因突变，为膀胱癌诊断、治疗提供了新思路。最新研究成果于2013年10月13日在《自然•遗传学》（Nature Genetics）杂志上发表。
膀胱癌发病率居泌尿系统恶性肿瘤的首位，而在西方国家其发病率仅次于前列腺癌，居第2位。膀胱移行细胞癌（TCC）是膀胱癌中最常见的组织学类型，男性发病率约为女性的3~4倍，多发生于40-70岁之间。目前，中国男性膀胱癌的年发病率已达十万分之八，并呈逐年上升的趋势。对于这一重要癌症，目前却没有充足的基因组学数据供科研人员开发新的治疗方法以攻克膀胱癌。
来自华大基因和市二院的科研人员对99个膀胱癌患者的组织样本进行了全基因组测序和全外显子测序，共发现13个重要的新突变基因和24个已知突变基因如TP53，HRAS, FGFR3,PIK3CA以及KRAS等。在所发现的新突变基因中，位于X染色体上的STAG2基因显得尤为特别，该基因与SCCS过程息息相关。科研人员发现STAG2基因发生了高频非同义突变，并且11个发生该基因突变的样品中有9个都是终止突变。此外，与SCCS相关的ESPL1基因也发生了高频突变。
研究人员还通过转录组测序对42对组织样品进行了研究，结果发现有32个潜在的基因重排可能会导致基因融合，并证实FGFR3和TACC3基因发生了融合。研究还发现，TACC3的高表达不是TACC3基因自身的扩增导致的，而是通过FGFR3这个转录调控因子来调节的。
此外，研究结果显示染色体的非整倍体性及不稳定性与膀胱癌发生有关，并使膀胱癌成为首个拥有SCCS相关基因突变的癌症。此外，本研究为膀胱移行细胞瘤提供了更全面综合的基因组突变信息，并证明基因突变可影响SCCS过程，同时为膀胱癌的诊断治疗提供了一种新的可能性。
华大基因该项目负责人陈超指出：“在这次研究中，我们发现了多个与SCCS相关的突变，包括STAG2、ESPL1基因的高频突变以及FGFR3-TACC3基因融合。这一发现证实SCCS相关基因突变确实与膀胱癌的发生有关，极大地推动了膀胱癌遗传学研究，同时也为膀胱癌的诊断治疗提供了新思路。此外，研究中所获得的数据资源也为以后膀胱癌的深入研究奠定了重要的科研基础。”（生物谷Bioon.com）
生物谷推荐英文摘要：
NATURE GENETICS doi：10.1038/ng.2798
Whole-genome and whole-exome sequencing of bladder cancer identifies frequent alterations in genes involved in sister chromatid cohesion and segregation
Guangwu Guo， Xiaojuan Sun， Chao Chen， Song Wu， Peide Huang， Zesong Li， Michael Dean， Yi Huang， Wenlong Jia， Quan Zhou， Aifa Tang， Zuoquan Yang， Xianxin Li， Pengfei Song， Xiaokun Zhao， Rui Ye， Shiqiang Zhang， Zhao Lin， Mingfu Qi， Shengqing Wan， Liangfu Xie， Fan Fan， Michael L Nickerson， Xiangjun Zou， Xueda Hu et al.
Bladder cancer is one of the most common cancers worldwide， with transitional cell carcinoma (TCC) being the predominant form. Here we report a genomic analysis of TCC by both whole-genome and whole-exome sequencing of 99 individuals with TCC. Beyond confirming recurrent mutations in genes previously identified as being mutated in TCC， we identified additional altered genes and pathways that were implicated in TCC. Notably， we discovered frequent alterations in STAG2 and ESPL1， two genes involved in the sister chromatid cohesion and segregation (SCCS) process. Furthermore， we also detected a recurrent fusion involving FGFR3 and TACC3， another component of SCCS， by transcriptome sequencing of 42 DNA-sequenced tumors. Overall， 32 of the 99 tumors (32%) harbored genetic alterations in the SCCS process. Our analysis provides evidence that genetic alterations affecting the SCCS process may be involved in bladder tumorigenesis and identifies a new therapeutic possibility for bladder cancer.
