近日，中国科学院北京基因组研究所基因组科学与信息重点实验室“百人计划”研究员雷红星，开展的“阿尔兹海默症染色体区域研究”取得阶段性进展，其研究论文《Chromosome 19p in Alzheimer’s disease： when genome meets transcriptome》于2013年8月在《Journal of Alzheimer's Disease》杂志上发表。该研究证明了在AD的脑部转录组中，染色体区域19p（chromosome 19p， chr19p）是最显著扰动的染色体区域；并提出了基因组和转录组两方面的证据，来表明chr19p在AD致病机理中起到的特殊作用。
阿尔兹海默症（Alzheimer's disease，AD），又称老年痴呆症，是一种进行性发展的致死性神经退行性疾病。目前，在全基因组关联研究（genome-wide association studies， GWAS）的背景下，散发性AD的遗传学机理还不是十分清楚。尽管遗传学研究已经确定了包括chr19p13.2在内的几个与AD显著相关的基因位点，但这些基因位点在AD的致病机理中所起到的功能作用仍有待进一步研究。
为此，雷红星研究员及其研究团队基于AD脑部转录组数据分析，找出了那些在散发性AD中具有较大扰动的基因，这些基因被认为在AD的致病机理中有着重要的调控作用。然后进一步考察了这些基因在不同染色体区域上的分布情况。研究人员发现chr19p是最显著扰动的染色体区域，而且它包含着chr19p13.2条带区。chr19p13.2在之前的遗传学研究中，被认为是迟发型AD（late-onset AD， LOAD）的主要遗传易感区域。与此同时，LOAD最显著的易感基因——APOE相关基因簇，也位于19号染色体的q臂上。基因组和转录组之间这种奇妙的关联，促使研究人员进一步去研究了chr19p 上那些显著扰动基因的功能。最后，研究人员分析了一组到目前为止最大的AD脑部转录组数据集，将其作为文章结论的一个独立验证。
在这些分析的基础上，雷红星研究员指出：“基因组和转录组两方面的证据都表明了chr19p在AD致病机理中起到的特殊作用，今后研究者们可以更加密切地关注chr19p上的一些变化。”（生物谷Bioon.com）
doi:10.3233/JAD-130917
PMC:
PMID:
Chromosome 19p in Alzheimer's Disease: When Genome Meets Transcriptome
Jiajia Wang1, 2, Xuemei Feng1, Zhouxian Bai1, 2, Lee-Way Jin3, Yong Duan4, Hongxing Lei1, 4
Genetic studies have identified several genomic loci including chr19p13.2 relevant to Alzheimer's disease (AD) susceptibility. However, the functional roles of these genomic loci in AD pathogenesis require further clarification. Transcriptome as an endophenotype is critical for the understanding of disease mechanism. Here we demonstrate that chr19p is the most significantly perturbed chromosome region in AD brain transcriptome. With dual evidence from genome and transcriptome, chr19p likely play a special role in AD pathogenesis.
