加拿大每年约有300万人到750万人受流感病毒感染，有500人至1500人因此而死亡。为此，加拿大非常重视流感疫苗的接种工作。自2000年以来，每年约有1000万人（占加拿大人口总数的1／3）接种流感疫苗。不过虽然流感疫苗在成人中的有效率达70％至90％，但加拿大去年和今年仍有流感疫苗接种者发现，他们最终还是患上了流感，其原因是这两年加拿大注射的流感疫苗与全球流行的流感病毒不相配。
从2003年12月开始，福建A型流感病毒在加拿大与美国及欧洲各地流行，这时期加拿大的流感约有95％为福建A型病毒。由于流感疫苗多在每年的10月份注射，而福建A型流感爆发较晚，它的菌株没有包括在2003／2004年年度流感季节的疫苗中。
在2004／2005年年度，加拿大接受了世界卫生组织的建议，把福建A型病毒菌株包含在了流感疫苗中，但这种流感好像突然不见了。根据今年全球流感报告，一种加利福尼亚A型流感病毒的变种却成为今年流感季节的主要麻烦制造者。
由于加拿大的国家微生物实验室只在几周前刚开始测试加利福尼亚A型流感病毒，加拿大卫生部门还不知道它是不是今年加拿大全国流感发生的主要原因。但卫生官员感到，如何使疫苗与病毒相配是个令人头痛的问题。流感病毒和疫苗总在玩猫捉老鼠的游戏。当一个人群通过感染或者疫苗对一种流感病毒产生足够免疫力后，病毒菌株就开始变化以求生存，而新的病毒可能更强。
流感病毒变异如此之快，世界卫生组织在决定疫苗成分时甚至需要碰运气。世界卫生组织官员已经建议在明年的疫苗中用加利福尼亚A型流感病毒菌株代替福建A型流感病毒菌株，但谁也不知明年的流感病毒是什么样子。
