艾滋病毒HIV对药物抗性的不断发展使得寻找新的抗病毒靶标成为一件非常紧迫的事情。支持HIV复制所需的寄主基因是一类很有潜力的新靶标,但是到目前为止在动物细胞中确定出的这类靶标却很少。加州大学的Suzanne Sandmeyer等人进行的一项新研究找出了100多个能够影响一个逆转录病毒模型的寄主基因。研究的结果公布在5月的Genome Research上。
许多有机体都含有一些逆转录病毒的非病原分子亲戚——机动遗传成分。在芽殖酵母中,这些机动成分(Ty成分,即transposable yeast)编码类似逆转录病毒蛋白的蛋白质。这些由Ty成分编码的蛋白和酵母的生命周期步骤与逆转录病毒编码的蛋白和动物细胞的上生命周期非常相似。研究人员相信单细胞生物中的这种简单成分是了解像HIV这样的逆转录病毒与寄主相互作用机制的一个很好的模型,而酵母在之前曾被用作研究癌细胞失控扩增的模型。
Sandmeyer的实验室对超过4457种代表了酵母大部分已知基因的突变酵母株进行了筛选。接着,他们在计算机专家Pierre
Baldi的帮助下集中研究了Ty3生命周期中比较重要的基因功能。他们还共同开发了一种能够分析大量遗传和生化数据以确定相关基因群的程序。他们总共确定出了130个影响类逆转录病毒Ty3成分复制的基因。
这项研究确定出的基因中的半数以上在人类基因组中至少有一个亲戚,因此这些发现提供了丰富的逆转录病毒寄主基因候选。研究人员希望这项研究最终能够促进新一代抗逆转录病毒疗法或药物的发展(记者杨淑娟)。