在2007年1月出版的《自然—方法学》上，研究人员报告了一种分析细胞遗传信息的新技术，为综合研究人类肠道内的所有细菌打开了一扇门。新技术让研究人员能够捕获和分析细菌世界的寄生虫，这种寄生虫的遗传信息通常会逃脱普通的检查。
对许多生物来说，一旦测出其基因组序列，那么就可获得确定重要功能基因的所有信息。然而，对细菌世界来说情况并非如此。许多细菌携带有寄生基因，它们储藏在名为质粒的小圆形DNA分子中。质粒不仅含有表达细胞新功能的基因，而且这些质粒的复制本也可被转移给其他细菌。
绝大多数试图确定生态系统中微生物特征的大型测序工作都不适合分析可提供额外基因的质粒复合群体。Julian Marchesi和同事描述了一种选择性捕获细菌寄生虫的方法，这样就可以对这些寄生虫进行测序。他们在人体肠内的细菌生态系统中试验了这种方法，发现质粒中含有已知和未知的功能。这种方法有助于确定这些小寄生虫的重要性以及它们对微生物生态系统的影响。
