8月15日电子版PNAS文章说到:霍华德休斯医学院分子和细胞生物学研究人员利用RNAi技术敲除体外培养的果蝇组织的TFIID特异亚结构(subunits),研究在体内环境中,究竟是哪种亚结构对维持TFIID稳定性具有关键作用。
TFIID是由TATA-box结合蛋白(TATA-box binding protein,TBP)和TBP协同因子(TBP-associated factors)在体内装配的复合物,可识别和结合核心启动子,目前关于TATA-box和TBP协同因子相互作用的机制还了解甚少。
TFIID酶依赖性聚集会引发转录前起始复合体(transcriptional preinitiation complex)形成。TFIID与核心启动子(core promoter )DNA结合,指导其它普通转录因子(general transcription factors,GTFs)参与组装,然后与RNA聚合酶II(RNA polymerase II)结合,引发RNA合成过程。
这一研究发现,TAF4相对于TBP和TAF1,对维持复合物的稳定性更重要;TAF5,TAF6,TAF9和TAF12对维持复合物稳定性有关键作用,TBP,TAF1,TAF2和TAF11对维持复合物稳定性作用不大。
研究人员推断:holo-TFIID的核心是由TAF4,TAF5,TAF6,TAF9和TAF12组成的稳定的亚复合体,在其外周围绕着TAF1, TAF2, TAF11, 和TBP等组分。提示:TAF1和TAF4在调节从含TATA较少,但含有下游核心启动子元件(downstream core promoter element ,DPE)的启动子区开始的转录过程中具有特异、明显的关键作用。而从含DPE较少,但含有TATA的启动子区开始的转录,几乎不依赖TAF1和TAF4。与同时表达TAF1和TAF4的情况相反,RNAi敲除TAF5对从两种启动子区开始的转录都影响不大。这些研究结果对先前关于TFIID组装、结构和功能的模型发出了挑战牌。