真核基因组在活体中不以裸露DNA形式存在,但在被称为染色质的蛋白-DNA复合物中是以裸露DNA形式存在的。染色质含有核小体,它们是紧紧包裹在一个组蛋白核心周围的短DNA片段,排斥大多数结合DNA的蛋白,所以起抑制剂的作用。在一项研究工作中,研究人员将计算方法和实验方法结合起来,用以确定核小体对DNA序列的偏好,并预测整个基因组范围内核小体的组织。酵母基因组编码一个内在的核小体组织,这可以解释活体中核小体位置的大约一半。该编码在不同真核细胞中都高度保留了下来,它的作用是将转录因子引导到它们的结合点,并辅助很多其他的特定染色体功能。本期一篇配发的News and Views文章讨论了DNA序列和其他调控因子在核小体定位中所起的作用。