基因组中还有隐藏的序列?这些序列会非常危险、无法与生命兼容?一个研究组这样认为。
与大多数的基因组测序计划不同(主要目标是寻找自阿种间保守的基因)这个研究组的目标是确定出对生命的存在有威胁的DNA序列和氨基酸链。
博伊西大学遗传学教授Greg Hampikian表示,这就好比大海里捞针的工作。他认为,必定有一些DNA或者蛋白质序列与生命不兼容,其原因或许是因为它们能与某种关键的细胞成分结合,从而比剔除循环之外。还可能,一些序列在某些物种中是致命性的,但是在另外一些物种中则无害。研究人员正是在寻找这些序列。
为了找到这些序列,Hampikian和同事Tim Anderson还开发出了一种能够计算核苷形成一特定长短度的可能序列的软件,并且分析序列数据库。
Hampikian的研究组特意搜索了最短的缺失序列,以使缺失序列随机丢失的可能性降低早最小。到目前为止,他们发现了由11个核苷构成的86个序列,而这些序列之前都没有报道在人类中发现过。
他们还确定出60000多个15个核苷长度的prime,以及746个由5个氨基酸长度的蛋白质“peptoprime”这些序列从未在任何种类中发现过。Hampikian相信,这项研究的结果将会得到广泛应用。他已经获得了美国国防部的100万美元资助,以开发出一种能够被增加到罪案DNA参照样本的一种DNA安全标记。