由西班牙巴塞隆纳超级计算机中心 (Barcelona Supercomputing Center)与该国国家生物信息研究院 (National Institute for Bioinformatics) 的科学家,共同在PNAS(Proceedings of the National Academy of Sciences) 期刊上发表一份论文指出,该研究团队利用超级计算机辅助的运算,尝试的了解复合蛋白质的架构过程,而透过掌握蛋白运作的过程,将有助于了解蛋白质体运作的真相,辅助药物的设计。
据了解这个称为 MoDel (Molecular Dynamics Extended Library)研究计划的主要目的,是希望透过运作动力学 (dynamic)的模式,了解复杂蛋白质复合体的活动情形,架构出蛋白结构信息的第四度 ('fourth dimension)空间信息,未来生物药学的研究人员,就可以清楚的掌握,具有活性分子的蛋白质行为,获得最佳药物设计的数据。
目前该研究团队由 15名研究人员组合,利用欧洲最具威力的超级计算机 MareNostrum,进行蛋白质体动力学活动的运算,在过去一年中,使用具有 200个中央处理器的分析中枢,进行了近50 万小时的平行分析,据参与的工作人员表示,这些动力学的运算工作,如果要利用最好的个人计算机进行分析,那可得花上至少 57年的工作时间,而目前高效能的工作成果,就是为了架构复合质的动力学图谱。