随着DNA长序列测序目标的实现,以及基因组、基因扩增产物的唾手可得,科学家们逐渐将研究的视角转向RNA:细胞中高度灵活、难以驾驭的生物聚合体。之前,它们在科学家们眼中只不过是一些信息载体(信使RNA和转运RNA),或偶尔具有功能的结构上的大分子(核糖体RNA)。但现在,一些非编码微小RNA、小干涉RNA分子,以及核糖开关(参见备注1)的发现逐渐占据了这个研究舞台的中心。
Puerta-Fernandez等对生活在极端环境(如强酸碱、高盐、高温)下的15种微生物的RNA进行分析,发现一条高度保守的非编码的长RNA序列(大约600个核苷酸)。通过对保守序列的二级结构分析预测出凸出(bulge)或环(loop)中存在很多保守区,暗示着此RNA的三级结构起着功能性抑制的作用,但至今为止它的作用仍是一个谜。该序列的附近基因都没有参与代谢途径的,但紧随该基因之后的下游序列中有个预计表达膜蛋白的基因,RNA可能可以与它形成复合体。
备注1:
riboswitches;在小分子诱导下发生构象改变,进而调控基因表达。
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Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 103, 19490 (2006).