在即将过去的2007年里,总有一些你记忆深刻、甚至终身难忘的事情。生命科学研究领域亦是如此。哪些科研成果是2007年最重大、影响最深远的研究成果? 随着人类基因组计划的实施和推进,生命科学研究已进入了后基因组时代。在这个时代,生命科学的主要研究对象是功能基因组学,包括结构基因组研究和蛋白质组研究等。2007年里,蛋白质组学研究获得了多个“第一”,取得了令人瞩目的成果。而这些新成果必将对了解生物大分子的作用机制和提高人类健康水平产生深远影响。
第一个蛋白质动态图谱出炉
来自西班牙巴塞罗那医药研究所、巴塞罗那超级计算中心生命科学组和巴塞罗那国家生物信息学研究所在国际权威杂志《美国科学院院刊》上公布了蛋白质动态行为的一个“临时”图谱。蛋白质决定着细胞的结构和形状,并且驱动细胞所有的关键过程。所有蛋白质都根据相同的过程执行它们的功能,即与其他分子结合。
研究人员破译的这张图谱展现出了蛋白质如何能移动并形成复合体。该图谱将能够帮助研究人员了解分子的基本功能,以及它们在功能出错时发生了什么。这个图谱也为新药设计提供了巨大的可能性。
这项研究的目的是确定一种非常典型的蛋白质类型的动态特征图谱。研究包括观察张开蛋白质弹性的基本规则,从而使研究人员能够预测这些蛋白质根据它的配基或修饰来形成的结构。
第一张人类器官蛋白质组图谱
我国“人类蛋白质组计划”有望实现肝癌诊治突破性进展。该计划实施3年来,围绕人类肝脏蛋白质组的表达谱等九大科研任务,我国科学家成功测定出6788个高可信度的中国成人肝脏蛋白质,系统构建了国际上第一张人类器官蛋白质组“蓝图”;发现了包含1000余个“蛋白质-蛋白质”相互作用的网络图;建立了2000余株蛋白质抗体,并将有望用一种与电脑连接的生物芯片,通过验血方式,准确地找出各类肝炎及肝癌的致病原因,既减轻诊断痛苦,又能做到对症下药。
新蛋白质组学方法引领蛋白功能研究革命
来自IRCM(Instiut de recherches cliniques de Montreal)的研究人员在7月20日的Molecular Cell杂志上发布的一篇文章描述了一种强大的蛋白质组学方法,该方法可能对我们目前了解人类蛋白质组和个体蛋白功能产生深远影响。
在这项研究中,研究人员利用蛋白质本身固有的特性开发出一种用于推断蛋白质功能的方法。Montreal研究组利用的这种独特的蛋白质特征就是蛋白质很少能单独起作用,而是与其他蛋白质装配成复合体来执行它们的功能。
IRCM的研究人员的策略主要是利用先进的蛋白质组学研究技术和他们自行开发的计算机运算方法,确定出许多已知功能蛋白质的相互作用伙伴。研究人员最初猜测相互作用的蛋白质可能是相同生物途径中的伙伴,并且可能具有相似或相关的功能。
通过系统地确定出32个已知在基因转录和DNA加工过程中起到特定作用的人类蛋白质的相互作用的同伴,该研究组已经构建出了连接436个不同蛋白质的805个高度确定的相互作用。
在这些蛋白当中,许多已经知道功能的蛋白质能够根据它们的相互关系来正确推出它们的功能。为了证实物理上相互作用的蛋白还在功能上具有相关性,研究人员选择了这个网络中一些之前未知功能的蛋白质来进行更详细的功能分析。