而新农合报销政策意在引导病人合理就医，分级诊疗，越到基层医院报销越多，越到大医院报销越少。在太原，按照政策，参合农民在省、市、县、乡医疗机构的报销门槛分别为800元、500元、300元、100元，报销比例各县区有所不同，大致为50%、60%左右、75%-80%、80%-90%。
据介绍，大医院虽然报销比例低，但治疗费用高、基数大，同一种疾病，省级大医院的治疗费用通常是县级医院的2倍多。郝宝清说：“但由于基层提供的医疗服务不够强，所以老百姓信任度不强、依赖性不高，小病也到大医院，就出现了小病大看等问题，从而给新农合资金造成了压力。”
长期自费诊疗形成的无序就医习惯也增加了新农合的负担。“现在很多老百姓经济条件好了，追求到大医院就医，但实际上，他少报的钱和新农合多花的钱比起来，差太多了。病人越向上流动，新农合负担越重。”太原市卫生局农卫处处长何进凯说。
以阑尾炎手术为例，县级医院需3000多元，而省级医院则要6000多元。在县医院，按75%的比例，新农合支出2250元；病人违规转诊，即使按政策被罚少报10%，新农合也要多支出150元。如果是较大疾病，无序就医产生的费用将更多。
