11月20日,据国外媒体报道,美国佛罗里达斯克利普斯研究院的科学家受天然产品启发,将合成化学的力量与高通量药物筛选技术相结合,创建了一种介于天然产品和合成产品之间的新种类小分子,其有望成为新药开发的基础。
新方法克服了小分子合成和筛选途径最新的分子限制,最终能扩展出数百万种令人兴奋的合成化合物,成为探索潜在药物的帮手。相关研究报告发布在11月20日的《自然—化学》杂志网络版上。
科研人员表示,高通量药物筛选是现代新药开发的重要组成部分。在这个筛选体系中,多种分子因为生物领域的潜在功能而被评估,药物开发是否成功则与评估下的分子集合的构成息息相关。目前的筛选中心保持了相对静态的分子集合,它们中的大部分都是可在商业领域应用的材料,不具有天然产品的结构,而天然产品已证实可在药物开发中起到引子作用。
为了扩大化合物的数量,科学家采用了一种可实现结构多样性的方法,其能模拟天然引擎,开发具有生物功能的分子。这一过程名为“齐聚反应”,是一种模块化的结构组装方式,类似于字母通过组合形成具有含义的单词。单分子单元能传送大量长度、结构和功能不同的聚合产物,如同词典中包含各式各样的单词一样。
将这种技术与由生物活性天然产品所激发的分子特性的合成设计相结合,尤其可获取聚酮化合物的天然产品,如红霉素和埃博霉素等。科学家构建了一个新的化学平台,从而有望发现潜在的治疗方法。
此次研究进展象征着化学、生物和医学界革命性发现的第一步。同时,这类科学的特性使得合成大量具有可预测、稳定、三维形状的且由天然产品激发的结构成为可能,并能实现低成本处理大量化合物的评估,显著改善药物学相关科学的未来。(生物谷 Bioon.com)
doi:10.1038/nchem.1200
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A biomimetic polyketide-inspired approach to small-molecule ligand discovery
Claudio Aquino; Mohosin Sarkar; Michael J. Chalmers; Kimberly Mendes; Thomas Kodadek; Glenn C. Micalizio
The discovery of new compounds for the pharmacological manipulation of protein function often embraces the screening of compound collections, and it is widely recognized that natural products offer beneficial characteristics as protein ligands. Much effort has therefore been focused on ‘natural product-like’ libraries, yet the synthesis and screening of such libraries is often limited by one or more of the following: modest library sizes and structural diversity, conformational heterogeneity and the costs associated with the substantial infrastructure of modern high-throughput screening centres. Here, we describe the design and execution of an approach to this broad problem by merging principles associated with biologically inspired oligomerization and the structure of polyketide-derived natural products. A novel class of chiral and conformationally constrained oligomers is described (termed ‘chiral oligomers of pentenoic amides’, COPA), which offers compatibility with split-and-pool methods and can be screened en masse in a batch mode. We demonstrate that a COPA library containing 160,000 compounds is a useful source of novel protein ligands by identifying a non-covalent synthetic ligand to the DNA-binding domain of the p53 transcription factor