近日，国际杂志Molecular Ecology Resources刊登了中科院昆明动物所车静副研究员等的最新研究成果“Universal COI primers for DNA barcoding amphibians。”，文章中，研究者在两栖类DNA条形码通用引物研究方面取得了新的进展。
DNA条形码技术（DNA Barcoding）近年来已成为国际上生物多样性研究的热点，即利用标准基因片段对物种进行快速、准确的鉴定和识别。该技术正广泛应用于生物多样性调查、分子进化、生态、环境、食品安全等诸多领域。
在脊椎动物中，目前鱼类，鸟类，以及极地动物在DNA条形码研究中进展较快，已有大量相关数据库在线。作为重要类群之一的两栖爬行动物，进展一直较为缓慢。在对两栖类的研究中，欧洲学者探讨了DNA条形码的鉴别能力，结果表明COI基因在该类群中鉴别物种方面是适合的，但是由于COI基因进化速率较快，序列保守性相对低，引物通用性差，极大阻碍了在全球两栖类群中开展相关工作。
中科院昆明动物所车静副研究员以及学生陈宏满和杨军校等人在张亚平院士的指导下，重新设计和优化了两对COI通用兼并引物，在中国两栖类的11个科、36个属、82个种111个个体中进行了验证，证实新设计的两对引物能够较广泛的用于两栖类DNA条形码研究。该结果目前已在线发表Molecular Ecology Resources。该引物目前在爬行类群测试中也得到很好的验证。
两栖爬行类是动物界中独特的一支，尤其两栖类代表由水到陆的转型过渡物种，对环境变化极为敏感，一直是研究环境和气候变化的指示物种。针对两栖爬行类DNA条形码工作不足的现状，昆明动物所于第四届国际生命条形码大会上提出两栖爬行动物DNA条形码“Cold Code”计划，致力于在全球范围内领导两栖爬行类标准标记基因筛选、技术体系构建、标准文库建设等方面发挥重要作用。
本研究得到了科技部基础性工作专项、基金委重大项目、中国科学院知识创新工程项目等的支持。（生物谷Bioon.com）
doi:10.1111/j.1755-0998.2011.03090.x
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PMID:
Universal COI primers for DNA barcoding amphibians
JING CHE1,*, HONG-MAN CHEN1,2,*, JUN-XIAO YANG1, JIE-QIONG JIN1, KE JIANG1, ZHI-YONG YUAN1, ROBERT W. MURPHY1,3, YA-PING ZHANG1,2
DNA barcoding is a proven tool for the rapid and unambiguous identification of species, which is essential for many activities including the vouchering tissue samples in the genome 10K initiative, genealogical reconstructions, forensics and biodiversity surveys, among many other applications. A large-scale effort is underway to barcode all amphibian species using the universally sequenced DNA region, a partial fragment of mitochondrial cytochrome oxidase subunit I COI. This fragment is desirable because it appears to be superior to 16S for barcoding, at least for some groups of salamanders. The barcoding of amphibians is essential in part because many species are now endangered. Unfortunately, existing primers for COI often fail to achieve this goal. Herein, we report two new pairs of primers (➀, ➁) that in combination serve to universally amplify and sequence all three orders of Chinese amphibians as represented by 36 genera. This taxonomic diversity, which includes caecilians, salamanders and frogs, suggests that the new primer pairs will universally amplify COI for the vast majority species of amphibians.
