微处理器复合体可以切割其它形式的RNA,如mRNA,有时候会产生一个类似于miRNAs靶点的瞬态结构,清除错误的RNA对于有机体来说有可能是灾难性的。近日刊登在国际著名杂志Nature Structural & Molecular Biology上的一篇研究论文中,研究者揭示了微处理器是如何平衡特异性miRNAs和效用性miRNAs之间的相互作用,一方面这并不是过于有效,但是对于清除非特异性的RNA很有必要;另一方面这个过程非常细致,因为过度特异性的风险辨识使得处理miRNAs并不充分。
科学家运用数学模型来表征微处理系统,并且在细胞中检测这种系统的记忆能力。研究者预测这种在特异性和有效应之间的平衡是通过一种反馈环路来完成的,而在这种回路中微处理器可以检测到细胞中大量的前提miRNA并且改变自身的miRNA产量。
通过在小鼠和人类组织中检测这种预想的存在,科学家揭示了微处理器确实可以调节miRNA前提的水平,如果细胞包含前提miRNA,则微处理器会提高自身的产量;然而当细胞中的miRNA降低以后,微处理器便会抑制其产量。这是通过Dgcr8 mRNA的消化来完成的。通过保持前提miRNAs的水平,微处理器可以降低其破坏RNAs的水平。
自从小RNA的产生可以错位一些疾病的治疗靶点后,研究者未来将会开发出更多的治疗方法。另外许多生物系统需要平衡有效性和特异性,研究小组的研究发现或许会提供思路和见解。(生物谷Bioon.com)
编译自:Living microprocessor tunes in to feedback
编译者:T.Shen
doi:10.1038/nsmb.2293
PMC:
PMID:
Efficiency and specificity in microRNA biogenesis
Omer Barad, Mati Mann, Elik Chapnik, Archana Shenoy, Robert Blelloch, Naama Barkai & Eran Hornstein
Primary microRNA cleavage by the Drosha–Dgcr8 'Microprocessor' complex is critical for microRNA biogenesis. Yet, the Microprocessor may also cleave other nuclear RNAs in a nonspecific manner. We studied Microprocessor function using mathematical modeling and experiments in mouse and human tissues. We found that the autoregulatory feedback on Microprocessor expression is instrumental for balancing the efficiency and specificity of its activity by effectively tuning Microprocessor levels to those of its pri-miRNA substrate.