2012年8月21日 讯 /生物谷BIOON/ --科学家们已破解一种分子密码，从而可能为破坏或校正缺陷性基因产物打开大门。这种密码通过一个被称作PPR(pentatricopeptide repeat)蛋白的蛋白超家族来决定着对RNA分子的识别。
当一个基因被开启时，它被转录为RNA。这个RNA然后被用来制造有机体实现至关重要的功能所必需的蛋白。如果一个基因发生缺陷，它的RNA拷贝和以此产生的蛋白将也存在缺陷。这就形成导致人类很多遗传疾病产生的基础。结合RNA的PPR蛋白可能能够在我们治疗疾病方面引发变革。它们的秘密在于它们的多样性：它们能够找到并结合一种特异性的RNA分子，而且如果它存在缺陷，那么它能够校正这种缺陷，或者如果它是有害的话，那么它能够破坏它。它们也能够有助于大批量产生生长和发育所必需的蛋白。
根据一篇刊登在PLOS Genetics期刊上的论文，研究人员第一次描绘PPR蛋白如何通过一种容易理解的密码来识别它们的RNA靶标。这种机制是在蛋白/RNA界面上模拟沃森和克里克60年前描述的DNA链之间配对的可预见性和简单性。
论文通信作者Ian Small说，“很多PPR蛋白非常重要，但是我们并不知道它们发挥着什么作用。如今，我们破解了这种分子密码，因而我们能够发现(它们所起的作用)。”
“更为重要的是，我们如今能够设计我们自己的人工合成蛋白来靶向我们选择的任何RNA序列---这应当允许我们以新的之前不能获得的方式来控制基因表达。这种潜力确实令人激动人心。”
论文共同作者Charlie Bond教授说，“这种发现是在植物中开展的，但是能够应用于多种物种，这是因为科学家们也在人类和动物中发现到PPR蛋白。”(生物谷Bioon.com)
本文编译自Molecular code cracked
doi: 10.1371/journal.pgen.1002910
PMC:
PMID:
A Combinatorial Amino Acid Code for RNA Recognition by Pentatricopeptide Repeat Proteins
Alice Barkan1*, Margarita Rojas1, Sota Fujii2¤, Aaron Yap3, Yee Seng Chong4, Charles S. Bond4, Ian Small
The Nanotechnology Characterization Laboratory's (NCL) unique set-up has allowed our lab to handle and test a variety of nanoparticle platforms intended for the delivery of cancer therapeutics and/or imaging contrast agents. Over the last six years, the NCL has characterized more than 250 different nanomaterials from more than 75 different investigators. These submitted nanomaterials stem from a range of backgrounds and experiences, including government, academia and industry. This has given the NCL a unique and valuable opportunity to observe trends in nanoparticle safety and biocompatibility, as well as note some of the common mistakes and oversights of nanoformulation. While not exhaustive, this article aims to share some of the most common pitfalls observed by the NCL as they relate to nanoparticle synthesis, purification, characterization and analysis.
