近日,英国《生物化学杂志》在线发表了生化与细胞所题为“Human cytoplasmic ProX edits mischarged tRNAPro with amino acid but not tRNA specificity”的最新研究成果,报道了人胞质ProX编校误氨基酰-tRNAPro的机理。
氨基酰-tRNA合成酶(aminoacyl-tRNA synthetase, aaRS)是一类古老的多结构域蛋白质家族,催化tRNA的氨基酰化反应,生成氨基酰-tRNA (aminoacyl-tRNA),为蛋白质生物合成提供原料。根据aaRS一级序列中的特征结构花式(motifs)以及催化功能域拓扑结构,20种aaRS被分为两类,I类酶和II类酶各10种。研究人员发现,存在一类蛋白质分子,它们的一级序列中包含了aaRS的特征结构花式,或者在三级结构上含有aaRS的某些特征结构域。这类蛋白质分子称为类氨基酰-tRNA合成酶(类aaRS)。与aaRS的经典功能相比,类aaRS的功能多样,包括蛋白质翻译控制、参与氨基酸合成和强化DNA合成等等。
一般认为,aaRS的祖先蛋白质分子以核心酶(core enzyme)存在,行使基本的催化功能。如今的aaRS是通过在该祖先核心酶在进化中逐渐插入其它结构域成为具有更多功能的酶而来。目前自然界所有已知的aaRS中,多数都有一些附加结构域,与tRNA识别、氨基酰化和编校相关。序列和结构类似性分析表明,类aaRS会在进化过程的不同阶段被aaRS的核心酶招募,成为当今aaRS的新结构域。独立存在的蛋白质分子ProX,广泛存在于多种物种中,与来源于细菌的脯氨酰-tRNA合成酶(ProRS)的顺式编校结构域(INS)同源。
王恩多研究组博士研究生阮亮亮、副研究员周小龙等研究了人细胞质ProX(HsProX)基因HsproX在人的9株不同的细胞系中的转录水平,首次通过HsProX的基因克隆和高表达得到了高纯度的蛋白质,研究了HsProX的编校功能。研究结果表明HsProX可以专一水解误氨基酰化的Ala-tRNAPro;虽然tRNA的CCA76末端对HsProX的编校活力至关重要,但没有tRNA的底物特异性。另外,鉴定了影响HsProX编校活力的关键氨基酸残基。
该工作得到了国家自然科学基金、国家重大科学研究计划、中国科学院上海生命科学研究院优秀青年人才领域前沿项目等项目的资助。(生物谷Bioon.com)
doi:10.1042/BJ20121493
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Human cytoplasmic ProX edits mischarged tRNAPro with amino acid but not tRNA specificity
Liang-Liang Ruan, Xiao-Long Zhou, Min Tan and En-Duo Wang
Aminoacyl-tRNA synthetases (aaRSs) are responsible for ensuring the fidelity of the genetic code translation by accurately linking a particular amino acid to its cognate tRNA isoacceptor. To ensure accuracy of protein biosynthesis, some aaRSs have evolved an editing process to remove mischarged tRNA. The hydrolysis of the mischarged tRNA usually occurs in an editing domain, which is inserted into or appended to the main body of the aaRS. In addition, autonomous, editing domain-homologous proteins can also trans-edit mischarged tRNA in concert or in compensating for the editing function of its corresponding aaRS. The freestanding ProX is a homologue of the editing domain of bacterial ProRS. In the present work, we cloned for the first time a gene encoding the human cytoplasmic ProX (HsProX) and purified the expressed recombinant protein. The catalytic specificity of HsProX for non-cognate amino acids and identity elements on tRNAPro for editing were also investigated. We found that HsProX could deacylate mischarged Ala-tRNAPro, but not Cys-HstRNAPro (UGG), and specifically targeted the Ala moiety of Ala-tRNAPro. The importance of the CCA76 end of the tRNA for deacylation activity and key amino acid residues in HsProX for its editing function were also identified.