目前，7种转基因作物包括1个转基因大豆和6个转基因玉米品种正在等待欧委会批准，欧盟食品安全局的风险评估结果为正面，但考虑来自各方的压力，欧委会宣布暂时冻结对新转基因作物的审批程序，转向寻求成员国重启谈判，让各成员国有权独自决定是否种植转基因作物成，尽管成员国各自为政被认为有损欧盟一体化关系。相关的作物由包括孟山都、陶氏益农、先正达等在内的农业跨国公司开发。
环保组织认为，欧盟目前无法评估转基因作物对环境和健康安全的长期风险，欧委会应该修复2008年的授权系统，彻底冻结转基因作物的审批程序并改革风险评估的方法，但至今为止欧委会的改革尝试都太胆小谨慎。
据《欧洲商业》、《欧洲动态》报道，14年来，欧盟只批准德国巴斯夫公司的Amflora土豆和孟山都公司的MON810玉米在欧洲种植，但仍受到消费者与环境组织的强烈批评与反对。欧盟各成员国中奥地利、保加利亚、法国、德国、希腊、匈牙利、卢森堡和波兰已通过禁止转基因作物种植的法规。而在美国获得批准的转基因作物超过90种，在巴西大约为30种。（生物谷Bioon.com）
