近期在斯德哥尔摩召开的世界水大会警告说，生物燃料曾一度被高度赞扬为解决未来燃油短缺和减少温室气体排放的绿色解决方案，现在看来并非如此十全十美。因为生物燃料由农作物加工而来，需要大量的水，而水在世界很多地方已经供不应求。生物能源因此会和急需水的食用农作物抢水。
根据斯德哥尔摩国际水研究院St(ockholm International Water Institute，SIWI)的报告，到2050年，在农业领域，生物燃料增加的水消耗将和生产人们食用农作物所需的水相当。生物燃料不是最好的解决方案。
印度“科学和环境中心”主任Sunita Narain说：生物燃料是一个好主意，但不是好办法。关键不是在于如何发展生物燃料，而是如何停止社会不断增加的燃料消耗；认为未来的世界可以像现在使用化石燃料一样使用生物燃料的观点是错误的。为此，她建议多使用公交交通，以减少路上的轿车。
除了水缺乏，专家们还担心大规模的生物燃料生产，会导致食用粮价大幅上涨。生物燃料将是食品生产的有力竞争者，全球食品价格将上涨。
据介绍，生产95升纯酒精，约需200千克玉米，这是一个人生存一年所需的热量。
