我国还没有一个生物柴油的国家标准，如果按照欧盟EN14214－2003（E）、美国ASTMD6751或中国GB/T20828－2007的标准检查的话，国内大多数生物柴油工厂均无法进行经济、环保、连续、稳定和大规模的生物柴油的生产。所谓经济的，就是一个生物柴油工厂需要有经济效益，否则工厂无法生存。同时，一个生物柴油工厂的生产必须达到环保的要求，由于我国原料和产品价格倒挂，目前可有效益地进行生产的生物柴油工厂所采用的原料基本上是废油或地沟油，这类生物柴油生产厂一般不进行三废的处理以保证企业盈利，而这一点与国家的环保政策相违背，从而导致这类工厂无法获得国家政策性支持。生物柴油的生产过程必须是连续和稳定的。虽然生物柴油的生产可采用间歇的方法进行，但是基于对产品品质的控制和连续化生产在节能降耗、工艺的先进性等方面表现出来的优势，世界上所有规模化的生物柴油工厂均采用连续生产工艺。而为了保证生物柴油产品能够顺利被中石油或中石化收购并将其调配后批发到各个加油站，必须保证生物柴油生产的规模化。目前已知的中石油生物柴油收购起点为每批量5000～10000t。
虽然国家在“十一五”的相关文件中规定可以对生物柴油生产工厂进行补贴，具体的补贴额度由地方政府制定，但由于目前国内生物柴油生产市场的混乱状况，我国还没有出台相应的补贴政策。随着国家费改税政策（成品油价格将上升约20%）和对生物柴油相关补贴政策（补贴和免税）的出台，在未来1～2年内，大规模、正规化的生物柴油项目投资将是有利可图的，这需要投资者把握机会，最大限度地争取地方政府的政策和税收支持。目前在江苏南通由奥地利壁陆（Biolux）公司投资，采用先进的CD工艺技术（生物柴油得率高于99%）处理800t/d菜籽油的生物柴油工厂正在建设中。该项目的生产技术和指标对于国内的生物柴油投资者非常具有参考价值。
