环境科学家于2010年4月底发布的一项研究表明，生物燃料与化石燃料碳足迹的比较表明，占用生产粮食的农业耕地而生产生物燃料，会使生物燃料生产的碳足迹增大。
据估算，美国生产的大豆，间接碳足迹为150kgCO2/ gigajoule (GJ)。而传统的汽油或柴油为85kg。
欧洲由油菜生产的生物柴油间接碳足迹为150kgCO2/ gigajoule (GJ)，而来自欧洲甜菜生产的生物乙醇经计算间接碳足迹为100kg，两者均高于常规柴油，这是由于间接使用了土地替代了粮食作物的生长。
而相比之下，来自拉丁美洲甘蔗和来自东南亚棕榈油生产生物乙醇的进口，其间接排放相对地低，分别为82kg和73kg/GJ，不过，此值仍较高，是因为虽然没有种植粮食土地被取代，但它使雨林减少而用于种植生物燃料作物。（生物谷 Bioon.com）
