自尼日利亚发现禽流感后，肯尼亚政府高度戒备，准备应对有可能在境内暴发的禽流感。
在肯尼亚医药研究中心，一个监控高致病性H5N1病毒的网络已经建立。该中心的负责人说，中心配备了必要的设备，能够及时发现和对候鸟进行检测，特别是检测那些死亡的候鸟。肯尼亚卫生部疾病暴发管理部门负责人尼兹卡博士说，现在各种切实的措施已经到位，能够应对任何可能暴发的禽流感。
世界动物卫生组织总干事瓦莱特说，禽流感可能从尼日利亚传播到邻国，但对肯尼亚来说，当前的威胁不是来自尼日利亚的鸟类，而是从欧洲沿尼罗河迁徙到东非的候鸟。他说，来自罗马尼亚、西伯利亚、土耳其、希腊和俄罗斯的候鸟很有可能已经抵达东非，它们可能感染当地的鸡和其它家禽。
面对这一紧急情况，肯尼亚已经采取了切实的措施。第一步就是对公众进行有关禽流感的教育，让公众认识问题的紧迫性，并做好准备以应对这一挑战。肯尼亚卫生部门的官员已经要求居民在发现家禽大量死亡的情况后，及时向兽医报告。他还劝告居民不要吃烧得不熟的鸡肉。兽医部门的官员也告诫居民，任何原因不明死亡的家禽都要深埋。
此外，肯尼亚已经禁止从发现禽流感的国家进口禽类和蛋类。这一临时性的禁令涉及鹦鹉一类的宠物鸟和那些准备进行孵化的鸟蛋，对从罗马尼亚、土耳其、希腊和俄罗斯和所有亚洲国家进口的家禽实行有指导的禁令，而对尼日利亚的家禽则全面禁止进口。
在肯尼亚的每一个进关口，包括边境和机场，都有卫生官员执勤，全面检查进入国内的所有禽类和蛋类。那些想要将鸟和蛋带进肯尼亚的人，需要获得卫生特别许可。
肯尼亚畜牧和渔业部说，肯尼亚养殖3000万只家禽，价值51亿先令（约合6900万美元），一旦禽流感暴发，这些家禽将面临威胁。虽然家禽业在肯尼亚整个国民经济中占的比重并不大，但75%的家禽养殖在农村地区，而肯尼亚3100万人口中有80%的人生活在农村，其中90%的家庭养鸡。禽流感袭来，将使农村地区许多人失去生活来源，生活更加贫困。
尽管禽流感还没有在肯尼亚流行，家禽的销售已经受到打击。肯尼亚人每天要消费120万只鸡，鸡也是快餐店、饭店和市场里销得最好的食品。但由于担心禽流感，现在鸡的销售量直线下降。肯尼亚最大的家禽生产企业Kenchic最近2个月的鸡肉产品销售已经损失了2600万先令（约合36万美元）。该公司的鸡肉销售量从前2个月的每周60吨跌至每周40吨。此外，由于乌干达禁止进口小鸡和成品鸡，肯尼亚45000公斤的产品没有了销路。
除了家禽业外，饲料业等相关产业也受到冲击，由于家禽养殖的减少，对饲料的需求相应也减少。
令肯尼亚政府更担心的是禽流感对正在稳定增长的旅游业造成冲击。旅游业是肯尼亚主要支柱产业之一。根据肯尼亚旅游局提供的数据，2005年肯尼亚旅游业的收入达489亿先令（约合6.7亿美元），旅游人数达168万，比上一年增长了24.5%。旅游业人士担心，禽流感将威胁野生鸟类。肯尼亚的纳库鲁湖、巴林格湖和博戈里亚湖是世界著名的观鸟胜地，这3个国家公园每年吸引30万游客，每月仅门票收入就达3000万先令（约合42万美元）。如果禽流感波及到这些地区，旅游者就有可能避而不来，这对肯尼亚经济将是重大损失。
为了抵抗禽流感并减少损失，肯尼亚政府已经与世界卫生组织达成协议，一旦禽流感在肯尼亚暴发，将以快捷、便利的方式从世界卫生组织那里得到一种抗高致病性H5N1病毒的药物。
肯尼亚卫生部也已经制定计划，如果国内发现这种疾病，卫生部将与农业、畜牧部，以及总统办公室采取联合行动。其他组织和团体，包括世界卫生组织、当地的大专院校、医药企业和医药研究中心都将同心协力，抗击禽流感。
