有业内人士指出，药价虚高的症结主要在于流通环节。
由于GMP改造的实施需要大量资金，这使企业在药物生产的成本上大大增加，从而提高药价；同时，企业为了生存更愿意生产利润高的新药，价格便宜的老药普药很可能因此在市场中消失。为此，有人质疑，药价会不会受GMP改造而有所提高呢？
药价是综合因素决定
对于大多数医药企业来说，进行GMP改造的最大困难在于资金。据了解，一条药品生产线的GMP改造至少需要投入2000万元以上，如果全厂进行GMP改造，费用将高达上亿元。这样高的造价，如果摊到药品的成本中，将是个不小的数字。
“通过GMP认证后，药品的生产成本肯定会增加，但不会直接影响到药价。”一位医药行业的人士解释说，“已经通过认证的1000多家企业，基本代表了国内医药界的主流，其产品的市场占有率达70%至80%，销售格局不会有太大变化。”
广东省药品监督管理局办公室副主任谢志洁分析道，GMP与药价并无直接关联，因为药价是一个多因素决定的结果，包括生产、销售等多方面成本以及渠道的建设。而GMP改造只是生产成本的一部分，GMP改造是一个必须的投入，是用药安全的前提。所以，以药价问题质疑GMP的可行性是不对的。
药价高在流通环节
知情人士告诉记者，目前企业亏损的原因主要不在于成本难以负担，产品没有利润，而是销售疲软、产品积压。而GMP认证可以淘汰没有实力的小企业，改变药品低水平重复、产品质量低下的现状。这对安全用药以及药品合理分布都有好处。而且，GMP改造可以使多余资源得到整合，减少浪费，从另一个方面节约了成本。
也有业内人士指出，药价虚高的症结主要在于流通环节。最赚钱的不是药厂，也不是终端的药店，而是批发商。药品流通的中间环节不只是想象中的一道两道，利润可能会经过几道甚至十几道的过滤。
普药不会消失
然而，令医药界更为担忧的是GMP认证给普药生产企业带来的压力可能直接导致普药在市场中的消失。一位药企老总忧心忡忡地说，目前3000多家药企中，以生产普药为主的企业占到80%以上，整改前的利润已经很小，整改后的利润可能会进一步缩水。“面对如此微薄的利润，还有多少药企会生产普药？”
美晨药业股份有限公司副总经理张荣说，GMP标准的实施使企业成本增加，为了盈利，企业当然宁愿生产新药。不过，一些大型制药厂的大批量生产将使某些普药老药成本降低，从而使这些普药继续为患者服务。
另一位制药企业的负责人则从市场的角度分析了普药消失的问题。他说，只要这个药物有价值，有市场，厂家就会生产。
普药目前的问题主要在于生产过多的而价格过低，如果很多企业放弃了该药物，竞争少了，药物的价值自然就会体现，所以，几乎不存在有价值的普药会消失的情况。有些企业为了企业知名度以及渠道营建，可能也会生产部分普药，这一点也是由市场调节来决定的。
