12月28日上午，2006年中国医药科技十大新闻评选结果在北京人民大会堂揭晓。吴孟超院士荣获2005年度国家最高科技奖、我国加强对艾滋病防治和科学研究、国家“十一五”期间加大对医药科技投入等在本年度产生重要影响的医药科技新闻上榜。卫生部副部长蒋作君、佘靖，国家食品药品监督管理局副局长吴浈，解放军总后卫生部副部长陈新年等领导出席揭晓大会并讲话。卫生部副部长兼国家中医药管理局局长佘靖介绍了“西京杯”2006年中国医药科技十大新闻评选经过并宣读入选条目。
据介绍，今年已是中国医药科技十大新闻评选工作开展的第十五个年头。该评选由卫生部、科技部、总后卫生部、国家食品药品监督管理局、国家中医药管理局、中国科协、中华医学会和健康报社等8个部门和单位联合主办，旨在盘点当年取得的重大医药科技成果和影响深远的医药科技相关事件，受到国家有关部门、传媒和公众的广泛关注。今年的评选活动由第四军医大学西京医院提供赞助，因此冠名为“西京杯”。
此次评选既强调了科学性，也兼顾到新闻性，体现了医药两翼、军地兼顾、中西并重和防治结合等评选原则。为更好地回顾总结过去15年的评选工作，在总后卫生部资助下，中国医药科技十大新闻评选办公室将1992年至今15年来入选的中国医药科技十大新闻整理并汇编成册，在今年的揭晓大会上印发。
入选“西京杯”2006年中国医药科技十大新闻的条目是——
一、在2006年全国科技大会上，中国科学院院士、著名肝脏外科专家吴孟超教授荣膺国家最高科技奖，成为自2000年该奖设立以来中国医药卫生界获此殊荣的第一人。
二、我国进一步加强对艾滋病的防治和科学研究。国务院公布《艾滋病防治条例》；广西疾病预防控制中心完成中国首个艾滋病疫苗Ⅰ期临床观察,中国疾病预防控制中心具有原始创新性艾滋病疫苗获准启动临床观察；北京协和医院领衔的中国艾滋病病人抗病毒治疗研究优选出适合我国国情的药物治疗方案；国家中医药免费治疗艾滋病项目扩大至14个省区市。
三、国家“十一五”期间加大对医药卫生科技投入。为落实《国家中长期科技发展规划纲要(2006～2020)》，先后启动“国家科技支撑计划”和“863”计划中人口与健康相关重大项目，并积极筹划实施“重大新药创制”、“艾滋病和病毒性肝炎等重大传染病防治”两个重大科技专项。
