2006年，上海生物医药全年工业总产值超过300亿元，其中医疗器械产值近100亿元。
2006年是“十一五”计划启动的关键一年。一年来，上海生物医药在结构调整、谋划战略布局、推进产业发展等方面取得了较大成绩。
上海现有生物医药企业446家，其中有上海医药集团、复星医药等大中型企业46家，境内外上市生物医药企业9家。
去年，上海生物医药重点企业的生产开始稳步增长，上药、复星和上实等3家龙头企业经过几年的调整以后，呈现稳定增长的发展态势；骨干企业在各自领域中的核心技术优势和产业竞争优势明显增强。
与此同时，一批重点扶持的优势企业加快国际化步伐。据统计，2006年1～10月，上海生物医药产业出口总额达41.01亿元，同比增长31.78%。出口产品也从以大宗原料药、低端一次性医疗器械为主逐步转向高附加值产品。
上海市科委、发改委、食品药品监管局2006年围绕国家战略和上海生物医药产业发展的需求，组织实施了一批前沿性科技攻关项目，推进已建的新药筛选中心、安全评价中心和药检所等公共服务平台的后续发展，同时着手建设药代中心、实验动物中心和临床试验机构等一批新的公共服务平台，为上海生物医药产业的持续创新积蓄了潜能。
2006年，由上海主持或参与主持的项目中，有4项国家“973”项目，24项“863”重大和重点项目，6个中药国际化项目。2006年1～11月，在生命科学领域，上海科学家在国际权威学术期刊《科学》上发表论文4篇，在《自然》上发表论文1篇，在《自然》系列期刊《自然医学》、《自然生物技术》、《自然细胞生物学》和《自然遗传学》上发表论文7篇，占全国的29%。全市生物医药领域专利公开数为2005个。有32个新药获得生产批文，74个新药获准进入临床研究，其中由本地企业负责生产和研制的创新药物9个。
2006年10月，国家发改委批准建设了上海国家生物产业基地，这为上海生物医药产业发展提供了新的机会。
据悉，2007年，上海将进一步提升生物医药产业的自主创新能力和核心竞争力，力争使上海生物医药产业迈上新台阶，生物医药制造业产值突破350亿元。
