2009年发布的国家基本药物目录包括基层医疗卫生机构配备使用和其他医疗机构配备使用两个部分。目前，已先期公布的《国家基本药物目录（基层医疗卫生机构配备使用部分）》（2009版），包括化药、中成药共有307个品种。
SFDA南方医药经济研究所广州标点医药信息有限公司的中国药品医院市场用药分析系统（HDM系统）和中国药品零售市场用药分析系统（RDM系统）这两大终端用析系统，对新旧基本药物目录药品的用药数据进行了对比分析与研究。
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