为积极稳妥地推进国家基本药物制度，指导基层医务人员合理使用基本药物，2009年12月30日，卫生部、国家中医药管理局组织编写的《国家基本药物临床应用指南（基层部分）》（以下简称《应用指南》）和《国家基本药物处方集（基层部分）》（以下简称《处方集》）正式发布，同时，主管部门要求各地做好培训和推广使用工作。
在我国，基本药物是指适应基本医疗卫生需求，剂型适宜，价格合理，能够保障供应，公众可公平获得的药品。政府举办的基层医疗卫生机构全部配备和使用基本药物，其他各类医疗机构也都必须按规定使用基本药物。建立国家基本药物制度，保证群众基本用药，是深化医药卫生体制改革的重要举措；通过制定相关政策措施，推动基本药物配备使用，使医疗机构愿意配，医务人员愿意开，就诊人员愿意用，以切实减轻人民群众用药负担。
《应用指南》和《处方集》是根据《国家基本药物目录》2009版基层部分编写的，主要用于指导和规范基层医务人员合理使用基本药物治疗基层常见病、多发病，也可供其他医疗机构医务人员使用基本药物时参考。
《应用指南》介绍了在疾病诊断明确的前提下，具有处方权的医生应当如何使用基本药物，以便规范医生的用药行为。《应用指南》基本覆盖了目前基层医疗卫生机构日常诊疗工作中的常见病、多发病。《应用指南》各类疾病的编写力求简明扼要、科学实用，内容包括概述、诊断要点、药物治疗与注意事项4个部分。
《处方集》根据《国家基本药物目录（化学药品和生物制品）》2009版基层部分收载的药物排列顺序进行编写，由前言、使用说明、总论、各论、附录和索引等部分组成。基本药物剂型严格控制在国家基本药物目录所规定的剂型范围内，规格为临床常用规格。为便于医务人员检索所需信息，《处方集》还编制了附录和索引。
卫生部部长陈竺之前在相关会议上指出，《应用指南》和《处方集》不仅是药物治疗的技术性规范，更是基本药物制度设计中的一个重要内容，对于推动基本药物制度的建立和实施具有重要意义。《应用指南》及《处方集》公布后，医疗卫生主管部门应强化培训工作，使基层医务人员能真正了解、掌握，推动基本药物在基层医疗机构的合理、规范使用。（生物谷Bioon.com）
