肝病专家指出，要想从根本上治好乙肝小三阳，最重要的就是不仅要有最好的治疗方案，还要选准乙肝治疗的最佳时机，即最佳治疗时机+最佳治疗方案=治疗乙肝小三阳最好的方法：
1、治疗乙肝小三阳最好的方法需要最佳治疗时机：有明显的症状，如疲倦、食欲不振、腹胀、肝区不适等；乙肝病毒脱氧核糖核酸(HBVDNA)检查呈阳性者；肝功能反复波动，转氨酶、血清胆红素升高，白蛋白降低等。
所以乙肝小三阳治疗的最佳时机需要在进行肝功能检查、HBV-DNA定量检查、B超检查结果出来后，经过专业医院肝病专家的具体分析，最终决定治疗的最佳时间。
2、治疗乙肝小三阳最好的方法需要最佳治疗方案：如果乙肝小三阳已经具备了最佳治疗时机，则首先要进行病毒耐药、变异检测，在科学检查的基础上进行辨病辨证具体分期分型，应用乙肝病毒变异、耐药检测(YMDD)，根据患者乙肝病毒基因的个体差异、病毒的变异、乙肝感染的病情、病毒DNA的复制情况、是否合并有其他病毒感染以及免疫状态等各种因素，制定针对性极强的个性化治疗方案，从而实现乙肝的康复治疗。
由此可见，治疗乙肝小三阳最好的方法需要乙肝病毒变异耐药检测系统和三氧自体血回输技术的支持，此方案因为对医院的软硬件环境要求条件相当严格，所以一般的医院是不能开展的。为了能取得更好的医治效果，建议乙肝小三阳患者到正规的大型医院进行诊治。