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自动进样瓶有多种封口方式和瓶口尺寸。广口样品瓶的开口尺寸比标准的开口大将近40%，广口的设计降低了进样针损坏的风险。
螺纹口样品瓶提供了一种低蒸发、可重复使用、比钳口盖对手伤害更小的封口方式，且无需额外的工具。螺纹盖样品瓶通过不同的螺纹规格进行区分，该规格由玻璃包装协会（GPI）定义。螺纹口样品瓶由两部分组成。举例来说，表示该样品瓶口螺纹外径为8mm，螺纹种类为425。螺纹口样品瓶及盖垫比钳口瓶价格高。
螺纹口样品瓶盖既有为自动进样设计的开孔盖也有为样品储存设计的实心盖，也有一体的PP盖子可选，这种可穿刺的螺纹盖为单次进样设计，由于不需要进行盖垫组装，可节省实验准备时间。
钳口样品瓶需铝盖进行密封，相对较便宜，当正确钳紧时，可为长时间储存提供最佳密封。钳口盖不可重复使用。
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