蛋白质功能研究新方法——“芯片上的实验室”
微流技术最近获得新的发展。加州理工学院的Sebastian Maerkl及其博士生导师Stephen Quake教授最近开发了一种“芯片上的实验室”,可以同时进行数千项实验测量,从而确定特定蛋白质如何与DNA粘连,揭开细胞复杂的基因与蛋白质网络之谜。科学家用该方法预测了酵母菌“转录因子”蛋白的目标基因,该结果发表在1月12日的《科学》杂志上。
除了可以同时进行成百上千个测量外,该系统还能够探测到相对微弱而短暂的分子间相互作用,取得其他实验中无法达到的效果。该方法为蛋白质功能与活性研究提供了一种新的手段,使科学家能够预测生物系统中单个蛋白质的行为作用。
科学家为该设备配备了一系列带有阀门哑铃状的注水池,通过在两侧放置荧光分子标记的DNA短序列和“转录因子”蛋白质,研究人员捕获到在中间连接起来的DNA和蛋白质,测定了蛋白质和DNA结合的强度,同时利用荧光总量测定了与蛋白质结合的DNA总量。
Maerkl表示,该方法最大的优越性在于测量简便。为了弄清楚细胞内蛋白质和基因的相互作用,研究人员往往要在电脑上进行模拟,但是现在,科学家有希望看清细胞内“转录因子”对DNA捆绑作用的全貌。同时,该方法还可以被用于更多深入广泛的实验,甚至有科学家认为,该整合平台将成为蛋白质间作用研究的一次飞跃。
Stephen Quake教授为Howard Hughes Medical Institute资助的研究员,2005年从加州理工学院移至斯坦福大学医学院。
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